白斑病毒感染凡纳滨对虾的高通量转录组测序及分析

转录组即特定组织或细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，Roche 454高通量测序技术一次运行可以获得上百万个读长片段，平均读长400bp以上，为转录组的测定与定量提供了快速简便的新方法。.抗病毒研究的策略之一是抑制宿主细胞中与病毒入侵或复制密切相关的蛋白功能，或者提高宿主细胞中抗病毒相关的免疫蛋白的表达。本项目拟利用Roche 454高通量测序技术，对白斑病毒感染及对照的凡纳滨对虾样品进行转录组测序，研究病毒感染及对照的凡纳滨对虾的mRNA表达谱差异，寻找病毒感染对虾差异表达基因，为筛选对虾抗病毒药物的分子靶标或研制对虾免疫增强药物提供依据，并可望发现一批凡纳滨对虾新基因，这对于我国积极参与国际上对虾基因知识产权的争夺有积极作用，转录组测序数据可供国内相关单位共享，对于加快我国的凡纳滨对虾病害防治和分子遗传育种研究进展有重要意义。

凡纳滨对虾是世界上养殖最广泛的甲壳动物。白斑综合症病毒（WSSV）是养殖对虾主要的病原体之一。然而，病毒-宿主相互作用的分子机制很大程度上仍然是未知的。本项目使用454焦磷酸测序技术，对WSSV攻毒和正常对照组对虾构建的cDNA文库进行RNA测序，研究WSSV感染对凡纳滨对虾肝胰腺的基因表达的影响。通过比较这两个cDNA文库，我们显示了WSSV感染导致的767个显著上调和729个显著下调的基因。差异表达基因的KEGG通路分析表明，上调和下调基因的通路的分布显著不同。在差异表达基因中，一些被发现是参与动物防御病原体的各种过程，如细胞凋亡、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号、Toll样受体（TLR）信号、Wnt信号与抗原加工和传递通路等。另外，为了更好的了解WSSV的作用机制，我们还进行了桃拉综合症病毒(TSV)和传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)的转录组测序作为对照研究。本研究提供了凡纳滨对虾在病毒感染后差异表达基因的有价值的信息，促进了我们对病毒和宿主的相互作用的了解。此外，本研究中获得了大量的转录本，克隆了一些基因的全长序列，为进一步的对虾基因研究提供了有力的依据。