线粒体单倍型与高原肺水肿易感性关联分析及其机制研究

高原肺水肿是(HAPE)一种特发于高原低氧环境的肺水肿，mtSNP与其易感性密切相关，可由少数标签mtSNP(tagSNP)构成单倍群和大量非tagSNP构成单倍型。本课题组在自然基金项目(《线粒体DNA单核苷酸多态性与高原肺水肿易感相关性的研究，30572087 》)的资助下，通过对204例HAPE病人(目前世界上报道最多的HAPE病例)和相匹配的174例健康对照mtDNA单倍群的深入分析，已经成功发现了单倍群B在HAPE病例组中的频率显著高于对照组(P=0.013, OR=2.118，95%CI: 1.194-3.756)。线粒体的单倍群主要用来限制样本的遗传背景，在每个单倍群内有多个非tagSNP构成的风险单倍型组合，本项目拟通过PCR－测序和细胞融合技术研究在单倍群B内的风险单倍型组合与HAPE的易感性的关系以及其在HAPE发病的分子机制，为寻求HAPE的预测方法打下坚实基础。

高原肺水肿是(HAPE)一种特发于高原低氧环境的肺水肿，mtSNP与其易感性密切相关，可由少数标签mtSNP(tagSNP)构成单倍群和大量非tagSNP构成单倍型。本项目通过PCR－测序研究在单倍群B内的风险单倍型组合与HAPE的易感性的关系以及其在HAPE发病的分子机制，为寻求HAPE的预测方法打下坚实基础。本项目通过PCR-测序，发现mtDNA ND1基因的3397A/G 与3552T/A 多态性与HAPE易感性相关，基因型mtDNA 3397G在HAPE中的频率 (2.3%) 显著高于对照组中的频率 (0%) (P=0.021, OR=2.806, 95% CI=2.443-3.223), 同时也发现基因型mtDNA 3552A在HAPE的频率 (6.8%) 也显著高于在对照组中的频率 (1.7%) (P=0.012, OR=4.198, 95% CI=1.264-13.880)。同时通过PCR-测序，在线粒体单倍群B中, 单倍群亚群B4c (标签SNP为15436A和 1119C) 是HAPE的危险因素，然而单倍群亚群B4b是HAPE的保护因素。同时申请者还发现在mtDNA的单倍群M中，mt5351G和mt 6680C基因型在HAPE病例组频率(12.0%)显著高于其在对照组中的频率(1.6%，P=0.016), 提示在单倍群M中mt5351G和6680C基因型是HAPE发病的危险因素, 是HAPE易感的遗传标记之一。线粒体的功能除了受序列影响外，还有mtDNA的数量相关，申请人通过研究发现HAPE患者血细胞mtDNA的拷贝显著低于平原汉族、移居汉族和世居藏族(P<0.05)，提示在高原肺水肿患者中mtDNA的拷贝数降低，可能是高原肺水肿的遗传标记之一， mtDNA的拷贝数受到mtTFA的调节。 通过上述研究，深入了解HAPE发病的线粒体DNA遗传机制。