菊花花器官EST构建与新基因发掘

菊花是我国十大名花之一，园林应用价值高。其品种繁多，遗传背景复杂。新基因的发掘靠传统基因分离法难度大、费时费工。本研究利用EST技术经济快捷、高通量的特点，以南农大自主选育的秋菊代表品种'金陵紫桂'（托桂型、粉色、短日照）为材料，采集其不同发育阶段花蕾构建非标准化混合cDNA文库，随机挑取5000个克隆用载体通用引物进行5'端测序以得到花器官ESTs；并采用BLASTx、GO、KEGG、COG等生物信息分析软件对得到的ESTs进行数据注释、功能分类和代谢途径分析，在此基础上描述菊花花序开放过程基因表达特点，发掘新基因。对在信息分析基础上筛选出的新基因运用Walking和RACE的方法获取目标基因的全部编码区和调控序列，并对目标新基因在不同组织的表达差异进行研究。本研究可丰富菊花花器官发生、发育的分子机理，加速新基因发掘与研究，推进分子育种，还可为菊花种质资源评价、遗传图谱构建提供标记。