中国肥胖儿童16p11.2基因组失衡热点的检测及临床与分子机制研究

基本信息
批准号:81000346
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:20.00
负责人:余永国
学科分类:
依托单位:上海交通大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:黄晓东,杨培蓉,李娟,沈烨,安康
关键词:
肥胖多重连接探针扩增(MLPA)16p112拷贝数变异(CNV)基因组失衡热点
结项摘要

虽然日益增多的儿童肥胖与环境因素密切相关,但大量证据表明儿童肥胖具有高度遗传性.人类染色体16p11.2区域呈高度拷贝数多态性。16p11.2两个相邻区域chr16:29.5-30.1Mb 和chr16:28.73-28.95 Mb的拷贝数变异(CNV)与孤独症、智力落后密切相关。课题负责人在分析美国孤独症儿童资料时发现这两个基因组失衡热点CNV与肥胖亦密切相关。本研究首先通过新一代多重连接探针扩增(MLPA)技术检测上述二个失衡热点CNV在500例中国肥胖儿童中的分布,同时通过收集完整的临床资料研究其饮食行为/能量平衡/代谢水平等临床病理机制;然后通过Affymetrix公司基因芯片进行全基因组基因转录表达研究,分析这两个区域共计包含51个基因在有/无CNV的肥胖儿童和正常体重儿童基因表达差异;最后使用通路分析软件(IPA)分析表达差异基因所涉及的信号传导通路,试图发现新的肥胖相关基因。

项目摘要

16p11.2区域拷贝数变异(Chr16:29.5-30.1Mb)是已知的儿童智力落后、孤独症的致病热点,但是否会导致儿童肥胖并不是很清楚。本研究通过基因芯片和MLPA技术检测中国智力落后和孤独症儿童发现28例上述失衡热点,进一步通过临床表型和基因型的关联分析发现:18例16p11.2缺失的儿童13例有肥胖表型;10例16p11.2的重复有早发型肥胖表型2例(<5岁),有意思的是临床表型有性别依赖性,男性儿童肥胖症状更明显(J Genet Genomics. 2011;38(9): 403-9);而且进一步机制研究发现16p11.2的缺失还会导致小头畸形,重复导致头围增加,有剂量依赖性(Nature.2011;478(7367):97-102)。.Chr16:29.5-30.1Mb区域一共包含40个基因,根据通路分析发现SH2B1最可能是肥胖的候选基因,筛选338例中国汉人肥胖儿童和221例完全匹配的正常儿童对照,SH2B1全基因测序发现肥胖儿童的SH2B1四个可能致病性变异,有趣的是进一步筛查FTO全基因变异发现SH2B1和FTO有协同共作用(PLOS One.2013;8(6):e67039)。.中国汉人肥胖儿童SH2B1其中一个变异为L293R,是磷酸化位点之一,推测SH2B1的磷酸化可能是儿童肥胖的原因机制之一,需要进一步功能验证。.本研究完成了项目计划书的所有内容,完全利用本项目资金发表相关SCI论文4篇,标注该基金资助SCI论文6篇,统计源核心期刊论文1篇,并有了进一步发现可以深入研究,出色的完成了课题任务。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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