对虾免疫相关基因簇的研究

近年来，模式生物和其他重要动植物的全基因组研究显示，真核生物一些功能基因倾向于成簇存在。由此我们推测，与对虾免疫相关的一些基因也很可能是成簇存在的。本课题在已构建的凡纳滨对虾细菌人工染色体(BAC)基因组文库和国内外对虾免疫网络研究最新结果的基础上，挑选包括Toll、proPO等通路中的LGBP、Toll、peneaidin、crustin、serine proteinase、prophenoloxidase等10-20个重要的免疫相关基因，设计特异性探针和引物，筛选含有这些基因序列的BAC克隆；通过指纹分析、contig组装、序列测定、生物信息学解读；发现对虾免疫相关基因簇，确定其中各基因或基因家族的主要结构特点，从基因组结构的角度阐释基因序列与功能的关系，以及对虾免疫基因的系统进化过程。这些工作可以为完善对虾免疫防御网络，深入了解对虾免疫调控机制和对虾抗病选择育种提供理论基础。

本课题在凡纳滨对虾BAC基因组文库的基础上，通过对BAC克隆序列、BAC末端序列和对虾转录组的分析，找到68条对虾免疫相关基因；通过对对虾BAC克隆和基因组序列的测序和分析，找到了Toll-eIF3-cuticlin等8个免疫相关基因可能成簇的现象并确定其主要结构特点；同时找到了数十个的对虾各基因簇上的转录调控元件，并对HSC70的启动子进行了功能鉴定和调控定位研究；完善了对虾中的Toll和IMD调控通路；初步分析了对虾免疫免疫系统的进化过程。这些工作可以为完善对虾免疫防御网络，深入了解对虾免疫调控机制和对虾抗病选择育种提供理论基础。