基于免疫组库测序技术对TCR/BCR多样性在新生儿败血症中的作用机制研究

基本信息
批准号:81471482
项目类别:面上项目
资助金额:73.00
负责人:孙金峤
学科分类:
依托单位:复旦大学
批准年份:2014
结题年份:2018
起止时间:2015-01-01 - 2018-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王莹,刘丹如,高燕燕,郑小青,惠晓莹,应文静
关键词:
B细胞受体新生儿败血症免疫组库T细胞受体
结项摘要

Despite the development of antibiotics and infection prevention measures, infection is still a major cause of neonatal deaths. It prompts us to seek new intervention strategies from the perspective of immunity. T cell receptor and B cell receptor (TCR/BCR) give the body the ability to recognize and respond to the antigen, and the polymorphisms of TCR/BCR is the key of effectively immune response to foreign antigens. However, the role of the polymorphisms of TCR/BCR in neonatal infection is unclear. So, the project will focus on neonatal sepsis, and analyze the TCR/BCR polymorphism using the new immune repertoire sequencing technology. In this study, we will do the following things: 1. Clarify the role of V, D and J genes in TCR/BCR polymorphism of different T cell and B cell subsets; 2. Elucidate the TCR/BCR characteristics of expanded T cells and B cells during the infection; 3. Investigate the other immune phenotypes, which associated with TCR/BCR, and analyze the association between the TCR/BCR polymorphism changes and the other immune phenotypes. Through the above mentioned study, we look forward to get the specific CDR3 sequence, which can be used as sepsis biomarkers or intervention target. The study will provide new idea for neonatal infection intervention.

尽管抗生素不断发展和预防感染措施不断完善,感染仍是新生儿死亡的重要原因,这促使我们从机体免疫的角度寻求干预策略。T细胞和B细胞受体(TCR/BCR)赋予机体抗原识别和应答能力,其多态性是保证个体对不同外来抗原发生有效免疫应答的关键,但对于其在新生儿抗感染中的作用尚不清楚。本项目以败血症新生儿为研究对象,利用新兴免疫组库测序技术,进行TCR/BCR多态性分析:1)明确不同亚类T细胞和B细胞V区、D区和J区基因在TCR/BCR多态性中的作用;2)明确新生儿在抗感染免疫反应中扩增的T细胞和B细胞的受体特征;3)通过与其他免疫表型数据的关联性分析,明确与新生儿感染相关的TCR/BCR多态性变化。以期通过本研究,阐明TCR/BCR多态性在抗感染免疫中的作用及其机制,并获得与败血症特异性相关的CDR3序列,这些CDR3序列有可能成为败血症的生物标志物或干预的分子靶点,从而为新生儿感染提供新的干预思路。

项目摘要

尽管抗生素不断发展和预防感染措施不断完善,感染仍是新生儿死亡的重要原因,这促使我们从机体免疫的角度寻求干预策略。T 细胞和B 细胞受体(TCR/BCR)赋予机体抗原识别和应答能力,其多态性是保证个体对不同外来抗原发生有效免疫应答的关键,但对于其在新生儿抗感染中的作用尚不清楚。本项目以败血症新生儿为研究对象,利用新兴免疫组库测序技术,进行TCR/BCR 多态性分析。完成26例健康新生儿和51例败血症新生儿治疗前后的免疫组库测序,并完成相关分析。结果发现:1. 新生儿处于免疫初始阶段,TCR多态性均低;2 对败血症新生儿来讲,第7天时点与第1天时点相比,TCR多态性明显增加,V区基因比例没有差异;3.与非感染新生儿比较,败血症新生儿CDR3长度均值较小;4.克隆频谱差异比较,败血症新生儿克隆的表达丰度明显低于非感染新生儿,第7天时点高于第1天时点。通过本研究,1)明确了不同亚类T 细胞V 区、D 区和J区基因在TCR多态性中的作用;2)明确了新生儿在抗感染免疫反应中扩增的T 细胞的受体特征;3)通过与其他免疫表型数据的关联性分析,明确与新生儿感染相关的TCR/BCR 多态性变化。通过本研究,有望为新生儿感染提供新的干预思路。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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