组蛋白共价修饰的生物信息学研究

组蛋白的共价修饰是表观遗传现象中重要的分子调控机制。组蛋白中被修饰氨基酸的种类、位置和修饰类型称为"组蛋白密码"，其中最主要的两种共价修饰为组蛋白的乙酰化和甲基化。一个广受关注的问题是：由甲基化和乙酰化修饰构成的"组蛋白密码"，究竟具有怎样的特异性？我们将在本项目的支持下，采用生物信息学与实验学的方法，将"干法"与"湿法"有机的结合，使用改进版本的GPS算法预测蛋白质的乙酰化和甲基化位点，并进一步发展酶特异性的乙酰化和甲基化位点的预测。我们拟结合蛋白质-蛋白质相互作用的信息，发展蛋白质组层面系统预测乙酰化和甲基化修饰底物及其位点的新方法。最后，在理论计算的指导下，我们将以实验学方法鉴定人类MYST亚家族的组蛋白乙酰基转移酶Tip60无修饰状态与SUMO化修饰状态下，组蛋白乙酰化的修饰位点。该研究将为深入理解DNA损伤修复通路中的组蛋白密码可塑性的分子机制奠定基础。