极地海洋嗜冷菌Glaciecola psychrophila 适冷应答的蛋白质组研究

Glaciecola属细菌广泛存在于海冰、海水、海洋沉积、海洋无脊椎动物等海洋环境，在海洋低温生态系统的物质循环中起重要作用。本项目以已完成基因组测序的海冰嗜冷菌G.psychrophila 170T为模式微生物，利用蛋白组学技术开展G.psychrophila适冷机制研究。构建不同培养温度下蛋白质差异表达谱，通过质谱分析和数据库检索确定已知蛋白功能，对未知功能蛋白借助全基因组序列进行分析，找出G.psychrophila适冷应答机制中的关键蛋白，对特殊蛋白点通过RT-PCR、Western和基因敲除等技术研究其表达及功能，以期全面了解G.psychrophila如何适应海冰这一寒冷环境，阐释G.psychrophila在海冰生态系统中的作用，为建立微生物冷适应进化模型，寻找可应用于低温环境修复、低温生物转化和冷冻防护等生物工程技术领域的新低温酶奠定基础。

Glaciecola属细菌广泛存在于海冰、海水、海洋沉积、海洋无脊椎动物等海洋环境，在海洋低温生态系统的物质循环中起重要作用。本项目以已完成基因组测序的海冰嗜冷菌G.psychrophila 170T为模式微生物，同时测序了4株嗜冷菌基因组。利用RNA-seq确定了与嗜冷相关的一些关键蛋白，如recA protein；　ATP-dependent Clp protease ATP-binding protein ClpA；cold shock-like protein cspE; NusA antitermination factor; chaperonin GroEL. 这候选基因为后面的功能验证提供了依据，为阐释G.psychrophila在海冰生态系统中的作用，为建立微生物冷适应进化模型，寻找可应用于低温环境修复、低温生物转化和冷冻防护等生物工程技术领域的新低温酶奠定基础。