基于点击化学-光交联活性分子探针的蟾毒灵抗癌作用靶点发现及机制探究

基本信息
批准号:21907093
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:23.00
负责人:齐欢
学科分类:
依托单位:中国科学院大连化学物理研究所
批准年份:2019
结题年份:2022
起止时间:2020-01-01 - 2022-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:
关键词:
靶点确证蟾毒灵活性分子探针基于活性的蛋白质组分析靶标发现
结项摘要

Defining the targets of traditional anticancer drugs is a critical issue to be addressed urgently for the precise chemotherapy of malignant tumor. Bufalin (BF) is one of the main effective active ingredients of the commonly used anticancer drug cinobufacine, however, its exact anti-cancer targets have not yet been elucidated. Our previous studies found that traditional quantitative proteomics methods could not accurately identify the targets of BF. Therefore, this project intends to introduce a powerful strategy of activity-based protein profiling (ABPP) to precisely explore the target proteins of BF. Recently, we have obtained the excellent BF active probes with photoaffinity groups and click-chemical groups as well as similar anticancer activities of BF. In this study, we will use the BF active probes to capture the functional active proteome with specific covalent binding, followed by identification using biomolecular mass spectrometry, analysis with bioinformatics and prediction by molecular docking software, and to discover the potential target proteins of BF. Furthermore, we will explore the biological functions as well as regulatory mechanisms of the potential targets in BF-treated cells by the means of cell biology and molecular biology, and ultimately clarify the anticancer targets and molecular mechanisms of BF. Collectively, our study will provide theoretical basis for the clinical use of cinobufacine and BF, and also provide a practical way for target discovery and confirmation of other small molecule drugs.

明确传统抗癌药物作用靶标是恶性肿瘤精准化治疗亟待解决的关键问题。蟾毒灵(BF)是临床常用抗癌药物华蟾素的主要有效活性成分之一,但其确切的抗癌作用靶标尚未阐明。前期研究表明,传统定量蛋白质组学方法不能准确鉴定BF抗癌作用靶蛋白。本项目拟引入能够精准挖掘BF作用靶标的基于活性的蛋白质组学分析(ABPP)策略:利用前期已合成的既保留了BF抗癌活性又可进行点击化学反应及光交联的BF活性分子探针,钓取与其特异性共价结合的功能活性蛋白质组,进而采用生物大分子质谱鉴定并结合生物信息学分析及分子对接软件预测,发现BF抗癌作用的潜在靶标蛋白。在此基础上,借助细胞生物学和分子生物学手段,确证潜在靶蛋白在BF对抗肿瘤过程的生物学功能和调控机制,最终阐明BF抗癌作用靶标及分子机制。本项目的开展可为临床精准使用华蟾素及BF提供理论依据,同时为小分子药物靶标发现和确证提供一条切实可行的途径。

项目摘要

蟾毒灵(BF)是从名贵中药蟾酥中提取的一种甾体化合物,是临床常用抗肿瘤药物华蟾素的有效活性成分之一。尽管现有研究报道了BF抗肿瘤作用机制涉及到多条信号通路,但是其确切的抗肿瘤作用靶标尚未明确。本研究通过合成并筛选出含有炔基及光亲和基团的BF活性分子探针(BF-ABP),建立基于活性的蛋白质组分析(ABPP)的方法,鉴定到肿瘤细胞内被探针标记的功能活性蛋白质组的成分;同时结合BF影响的肿瘤细胞转录组学结果,通过生物信息学方法预测了BF抗癌作用的潜在靶标分子;利用细胞分子生物学手段以及代谢组学技术,进一步探究了BF通过靶标蛋白对抗肿瘤过程的分子机制以及靶标蛋白的生物学功能。通过研究,我们获得了理想的BF-ABP及对照探针BF-ABP-CON,成功建立了细胞原位荧光标记方法和ABPP方法,同时与转录组学整合分析挖掘到BF可显著抑制肿瘤细胞内蛋白质翻译过程,其潜在作用靶点为翻译起始因子EIF4G1。此外,我们基于代谢组学探究了BF潜在作用靶点白细胞介素增强子结合因子(ILF)2/3调控的代谢通路,结果表明这两个结合因子在肿瘤进程中与支链氨基酸相关代谢具有非常紧密的调控关系。本研究一方面为临床精准使用华蟾素及BF提供了科学依据,另一方面同时将ABPP、转录组学、生物信息学、细胞分子生物学以及代谢组学等多组学多学科进行系统性地有机结合,为小分子药物作用靶标的发现和确证提供一条切实可行的思路和途径。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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