基于sirtuins酶结构的化学探针设计

基本信息
批准号:21672233
项目类别:面上项目
资助金额:65.00
负责人:刘东祥
学科分类:
依托单位:中国科学院上海药物研究所
批准年份:2016
结题年份:2020
起止时间:2017-01-01 - 2020-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:马泽为,韩昊真,盖伟,王敏,陈秀颖
关键词:
Sirtuins化学探针基于结构的分子设计赖氨酸去乙酰化酶蛋白配体相互作用
结项摘要

Protein deacetylation is an important post-translational protein modification, which is catalyzed by the lysine deacetylases (KDAC). Sirtuins, a class of NAD(+)-dependent KDAC, play important roles in many biological processes such as gene transcription, fatty acid metabolism, insulin secretion and apoptosis. Currently, many studies are focused on their functions, the signal pathways and their correlation to human diseases. To help study the biological functions of sirtuins, here we aim to develop isoform-selective sirtuins activators or inhibitors, which can serve as chemical probes to modulate the activity of various sirtuins in real-time and in situ. Moreover, sirtuins are involved in the genesis and development of cancer, inflammation, metabolic diseases and neurodegenerative diseases. Thus, these modulators may also be used in the study of the relevant diseases.

蛋白去乙酰化是生物体内一种重要的蛋白质修饰,它需要赖氨酸去乙酰化酶催化完成。Sirtuins是一类NAD+依赖型的赖氨酸去乙酰化酶,在基因转录、脂肪酸代谢、胰岛素分泌、细胞凋亡等许多生命过程中发挥重要作用。目前,确证sirtuins的生物学功能是该领域的一个研究热点,特别是对于它们所调控的信号通路以及与疾病的相关性还有待深入研究。以sirtuins为靶标,设计合成小分子探针,实现实时、原位定量调控sirtuins酶活,可极大促进体内sirtuins的生物学功能研究。为此,本课题将发展具有亚型选择性的sirtuins激动剂、抑制剂,这些激动剂、抑制剂能特异性地调节不同sirtuins亚型的酶活,作为探针分子,可用来帮助研究sirtuins的生物学功能。另外,因sirtuins在癌症、炎症、代谢性疾病和神经退行性疾病的发生、发展过程中扮演重要角色,这些探针化合物也可用于相关疾病的研究。

项目摘要

蛋白去乙酰化是生物体内一种重要的蛋白质修饰,它需要去乙酰化酶催化完成。Sirtuins是一类NAD+依赖型的去乙酰化酶,在基因转录、脂肪酸代谢、胰岛素分泌、细胞凋亡等许多生命过程中发挥重要作用。以sirtuins为靶标设计合成小分子探针,实现实时、原位定量调控sirtuins酶活,可促进体内sirtuins的生物学功能研究。为此,本课题发展具有亚型选择性的sirtuins激动剂、抑制剂,这些激动剂、抑制剂能特异性地调节不同sirtuins亚型的酶活,作为探针分子,可用来帮助研究sirtuins的生物学功能。另外,sirtuins在癌症、炎症、代谢性疾病和神经退行性疾病的发生、发展过程中扮演重要角色,这些探针化合物也可用于相关疾病的研究。通过该课题研究,我们发展了一类对SIRT1、SIRT3、SIRT5抑制活性在nM级、对SIRT2抑制活性约1uM的强效泛抑制剂。我们还发展了一类SIRT1选择性抑制剂,其中化合物12n对SIRT1抑制活性IC50为460nM,比文献报道的活性最好SIRT1抑制剂EX-527(IC50:990nM)强一倍,这也是目前最强效的SIRT1选择性抑制剂。我们还发现SIRT2、SIRT3蛋白的C位点构象具有可塑性,靶向该位点,优化抑制剂的化学结构,可提高其抑制活性和选择性。另外,我们还发展了D型氨基酸多肽CWR,能够明显促进SIRT1酶活,不同于文献报道的所有SIRT1激动剂,该激动剂并非作用于SIRT1的N-端,而是作用于SIRT1的C-端loop区,通过增强乙酰化底物与SIRT1的结合,促进SIRT1介导的底物去酰化。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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