胎儿非综合征先天性心血管畸形全基因组拷贝数变异分析

According to etiology,fetal congenital heart disease(CHD) can be divided into two types of known syndrome and sporatic,Non-syndrome.This project will selects cases of fetuses with Non-syndromic congenetial heart disease as research targets.Using the techniques of genome-wide Array-CGH or next-generation DNA sequencing,we manage to discover suspecious disease-assciation copy number variants in the research cases. Comparing with biological information from control cases of normal fetuses, disease-association copy number variants could be identified.This project can overcome shortages such as rare type of CHD by selectiong live birth's cases with CHD and let us understand comprehensively the pathogenesis of CHD.

胎儿先天性心脏病可分为已知的综合征性先天性心脏病和散发的、病因未明的非综合征性先天性心脏病。本课题通过对胎儿先天性心脏病病例进行细胞遗传和分子遗传学研究，筛选出非综合征性胎儿先天性心脏病病例，进一步进行全基因组拷贝数变异关联研究，发现可疑致病性拷贝数变异，经与因计划生育等原因引产的胎儿组织标本进行比对和遗传流行病学统计分析，筛选出导致非综合征性胎儿先天性心脏病的致病性拷贝数变异。本课题能够克服目前国内外先心病遗传因素研究主要以活产患儿作为研究对象存在的病种较少、不能覆盖胎死宫内或出生即夭折的先心病病例的局限，从而更广泛、深入地研究心血管系统畸形的类型及其发病机制，可望发现新的致畸基因变异类型，进一步揭示先天性心脏病发病的分子机制。

胎儿先天性心脏病（Congenital heart disease,CHD）可分为已知的综合征性CHD和散发的、病因未明的非综合征性CHD。本课题通过对胎儿CHD病例进行细胞遗传和分子遗传学研究，筛选出非综合征性胎儿CHD病例，进一步进行全基因组拷贝数变异（Copy number variation,CNV）关联研究，筛选出导致非综合征性胎儿CHD的致病性CNV。到目前为止，共收集了402例经超声诊断为先天性心脏畸形的胎儿，其中包括活产、死产、出生即夭折以及暂未出生的胎儿。其中42例样本为引产后脐带、绒毛及组织，余下360例胎儿的样本为羊水、活检绒毛及脐带血。我们对42例引产胎儿进行了染色体微阵列分析，对余下360例胎儿中的355例同时进行G显带染色体核型分析和染色体微阵列分析（另外5例因孕周过大羊水细胞培养失败）。结果如下：1、共检出86例致病性CNV；12例可能致病的CNV；21例临床意义未明的CNV，7例可能良性的CNV。致病及可能致病CNV的检出率为24.4%（98/402），染色体数目异常占9.5%（38/402）。2、按是否合并其他异常将胎儿CHD分为4类：单纯CHD组，253例，占62.9%；CHD合并心外结构畸形组，107例，占26.6%；CHD合并FGR组，21例，占5.2%；CHD合并软指标异常组，27例，占6.7%。有6例CHD胎儿既合并心外畸形又合并有FGR。3、各组致病和可能致病CNV的检出率及两两比较：单纯型CHD组为16.2%（41/253）；CHD合并心外结构畸形组为39.3%（42/107）；CHD合并FGR组为42.9%（9/21）；CHD合并软指标异常组为33.3%（9/27）。单纯CHD组和CHD合并心外结构畸形组比较差异有统计学意义；单纯CHD组和CHD合并FGR组比较差异有统计学意义；其他小组之间两两比较均无统计学意义。4、两种检测方法的比较：染色体核型和染色体微阵列对异常CNV的检出率分别为14.6%（52/355）和29.6%（119/402），二者差异有统计学意义。5、对31例未检出染色体数目异常和拷贝数变异的胎儿先天性心脏病病例，进一步进行全外显子组高通量DNA测序分析。其中检出12例单基因可疑致病或致病突变病例，10例胎儿先心病标本检出临床意义不明基因突变。9例胎儿先心病标本未检出与先心病相关的基因突变。