先天性输精管缺如的全基因组拷贝数变异研究

基本信息
批准号:81671448
项目类别:面上项目
资助金额:60.00
负责人:李宏军
学科分类:
依托单位:中国医学科学院北京协和医院
批准年份:2016
结题年份:2020
起止时间:2017-01-01 - 2020-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王晶,文进,王海,唐佐青,金伟,郭野,杨彬,陈志刚
关键词:
生物信息学分析先天性双侧输精管缺如拷贝数变异全基因组微阵列芯片
结项摘要

Congenital bilateral absence of vas deferens (CBAVD) is a rare malformation of male reproductive system, representing an important cause of non-obstructive azoospermia. CFTR is the only causative gene being identifed to date. Meanwhile, almost 40% of Chinese patients harbor no CFTR mutations, indicating the existence of other pathogenesis mechanisms of CBAVD. The results of our preliminary study suggest a potential role of CNV in the development of CBAVD. Therefore, we plan to genome-wide screen a larger sample of non-CFTR-mutation patients, perform comprehensive bioinformatic analysis and identify candidate CNVs. Finally, candidate CNVs will be validated in 250 sporadic patiens, aiming to identify CBAVD causative CNVs and hot-spot reigons. Our study will provide new evidence to the pathogenesis research and clinical therapy of CBAVD.

先天性双侧输精管缺如(congenital bilateral absence of vas deferens, CBAVD)是一种少见的男性生殖系统畸形,是梗阻性无精子症及不育的重要原因。目前只有一个CBAVD致病基因CFTR被发现,同时,中国人群中约40%的CBAVD病例不携带CFTR基因突变,表明CBAVD存在其他的致病机制。申请人前期研究已有比较明确的提示,拷贝数变异(copy number variation, CNV)有可能是CBAVD的致病因素之一。本研究拟在此基础上,对扩大样本的CBAVD患者进行全基因组芯片扫描和综合生物信息学分析,识别候选致病CNV;然后在二期病例中进行验证,最终鉴定CBAVD相关致病CNV和热点区域。我们的研究结果将为全面了解CBAVD发病机制、临床诊治等提供依据。

项目摘要

先天性输精管发育不全(CAVD)是囊性纤维化(CF)的一种非典型形式,可导致阻塞性无精子症和男性不育症。除了CFTR的常见突变外,CFTR基因的拷贝数变异(CNV)和复合杂合变异也被认为是CAVD的发病机理之一。本课题首先通过全基因组高通量芯片检测了CAVD患者的全基因组拷贝数变异分布。进而,进行了靶向CFTR基因区域的多重连接依赖性探针扩增试验。在263名患有两个输精管先天性发育不良的中国男性中,检测到患者的CFTR基因区域存在拷贝数变异。该研究首先揭示了中国汉族人群中大量CBAVD患者的CFTR CNV的遗传风险,这提示有必要检测中国CBAVD汉族患者CFTR的CNV。.此外,在这个项目中,我们在CAVD家系中对CAVD患者进行了全基因组测序和共分离实验,在这两名患者中均发现了罕见的移码变异(NM_000492.3:c.50dupT; p.S18Qfs * 27)和常见的导致CBAVD的变异(IVS9-TG13-5T)。这个罕见的移码变异可产生截断蛋白。共分离实验证实这两个变异的复合杂合遗传。这个发现可能会拓宽CAVD患者CFTR的突变谱,并提供更多的家族证据,表明CFTR变异的组合可导致输精管畸形。

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

基于LS-SVM香梨可溶性糖的近红外光谱快速检测

基于LS-SVM香梨可溶性糖的近红外光谱快速检测

DOI:
发表时间:
2

基于文献计量学和社会网络分析的国内高血压病中医学术团队研究

基于文献计量学和社会网络分析的国内高血压病中医学术团队研究

DOI:10.11842/wst.20190724002
发表时间:2020
3

汽车侧倾运动安全主动悬架LQG控制器设计方法

汽车侧倾运动安全主动悬架LQG控制器设计方法

DOI:
发表时间:2017
4

高分五号卫星多角度偏振相机最优化估计反演:角度依赖与后验误差分析

高分五号卫星多角度偏振相机最优化估计反演:角度依赖与后验误差分析

DOI:10.7498/aps.68.20181682
发表时间:2019
5

基于自适应干扰估测器的协作机器人关节速度波动抑制方法

基于自适应干扰估测器的协作机器人关节速度波动抑制方法

DOI:10.13973/j.cnki.robot.210412
发表时间:2022

相似国自然基金

1

ADGRG2基因变异导致先天性输精管缺如的分子遗传机制研究

批准号:81871152
批准年份:2018
负责人:李宏军
学科分类:H23
资助金额:56.00
项目类别:面上项目
2

CFTR基因突变在汉族先天性输精管缺如中的机制研究

批准号:81571424
批准年份:2015
负责人:张炎
学科分类:H0401
资助金额:60.00
项目类别:面上项目
3

利用外显子组测序技术识别先天性输精管缺如新基因

批准号:81370698
批准年份:2013
负责人:李宏军
学科分类:H0401
资助金额:70.00
项目类别:面上项目
4

汉族先天性输精管缺如CFTR基因启动子区域突变及致病性研究

批准号:81771565
批准年份:2017
负责人:张炎
学科分类:H0401
资助金额:55.00
项目类别:面上项目