异常表达基因miRNA结合区域功能性遗传变异与淋巴瘤易感关系研究

Single nucleotide polymorphisms (SNPs) located at 3′ untranslated regions (3′ UTR) of genes might modulate the expression of genes by affecting their binding ability to certain miRNAs, therefore, be associated with individual susceptibility to cancer development and progression. This study sought to investigate genetic variations within 3′ UTR of genes that are be dysregulated in lymphoma and evaluated their effects on susceptibility to cancer. Electronic databases will be used to find dysregulated genes in RNA level in lymphoma and to identify putative SNPs within miRNA target sites. The minor allele frequency of selected SNPs must also be according to the criteria that are greater than or equal to 10% in Han Chinese population. These SNPs will be genotyped using TaqMan platform in a case-control set in Han Chinese population. A set of biochemical assays will be conducted to examine the function of SNPs. This study will clarify the mechanism including joint effects of SNPs in gene 3′ UTR and miRNA that affect gene expression and the biological progression of lymphoma, while also provide evidence of early prevention and warning for lymphoma.

miRNA靶基因3′UTR的SNP可能改变靶基因与miRNA的结合而影响基因表达，进而影响肿瘤的遗传易感性。本项目拟研究淋巴瘤异常表达基因miRNA结合区域的遗传变异与淋巴瘤易感性的关系。我们首先利用网络数据库汇总公认的淋巴瘤表达失调基因；筛选其3′UTR中miRNA结合区域的SNP，选取其中中国汉族人群中最小等位基因频率≥10%的SNP并在较大规模的病例-对照中进行关联分析，找出与淋巴瘤发病相关的SNP；最后运用一系列生物化学和分子生物学方法研究功能性遗传变异与淋巴瘤遗传易感性的关系，探讨其生物学功能，进一步了解淋巴瘤发生的内在机制。本研究将阐明基因3′UTR的遗传变异与miRNA联合作用影响基因表达进而影响淋巴瘤发生发展的生物学机制，为淋巴瘤的早期预防和预警提供依据和新线索。

本课题研究淋巴瘤异常表达基因3′ UTR的SNP影响淋巴瘤发生的分子机制。利用网络数据库汇总50个公认的淋巴瘤表达失调基因；筛选其3′UTR中miRNA结合区域的SNP，选取其中4个CHB中MAF≥10%的SNP（rs1042752、rs158688、rs1053509和rs3217927），在793名资料完整的淋巴瘤患者和939名正常对照中进行关联分析，发现处于POU2AF1的3′ UTR的rs1042752T>C可能与淋巴瘤的发病相关，与TT基因型相比，CC基因型携带者患淋巴瘤风险显著增加（OR = 2.14, 95% CI: 1.55–2.95, P < 0.001）。.使用等位基因特异表达的方法检测了12例携带rs1042752TC杂合基因型患者淋巴瘤组织中POU2AF1的cDNA表达情况，发现携带rs1042752T基因型淋巴瘤组织中POU2AF1的表达是rs1042752C基因型的0.89 ± 0.07倍，说明在体内，rs1042752T>C与POU2AF1的表达相关。.经过数据库查询发现，rs1042752可能影响hsa-miR-633与POU2AF1 3′ UTR相互作用进而影响基因的表达，而hsa-miR-633在淋巴细胞白血病患者骨髓等细胞中高表达。细胞实验表明：在Romas、HuT 102和Jurkat E6-1中，rs1042752C破坏了hsa-miR-633与POU2AF1基因3′ UTR的相互作用，造成了基因组成型高表达。综上，处于POU2AF1 3′ UTR区域的rs1042752T>C与淋巴瘤患病风险相关，rs1042752C破坏了hsa-miR-633与POU2AF1 3′ UTR的相互作用，造成了POU2AF1组成型高表达，促进淋巴瘤的发生。.本研究结果进一步阐明了遗传因素导致POU2AF1异常表达引起淋巴瘤的发生机制，对明确淋巴瘤的病因，寻找易感者的遗传标记都具有重要意义，也为今后淋巴瘤的基因治疗奠定理论基础。..此外，受本基金资助，研究了肿瘤坏死因子α（TNF-α）启动子遗传变异（-308G>A）与NHL发病的关系。发现在白种人和亚洲人群中，TNF-α-308G>A在NHL的发病中起相反作用，进而推测TNF-α在NHL的发生发展过程中的作用机制可能不同。