肿瘤相关基因中微小插入缺失多态与肝细胞肝癌的关联性研究及功能分析

微小插入缺失多态(Indels)广泛分布于人类基因组，其数量仅次于单核苷酸多态并已在肿瘤病因、药物设计等方面展现出巨大的应用前景。但由于缺乏高通量分型方法，Indels相关研究较其他遗传标记明显滞后。我们近期的研究表明，肿瘤相关基因中的Indels与肝细胞肝癌(HCC)发生存在显著性关联，获得了Indels参与HCC发生的可靠证据。本项目拟采用生物信息学方法筛选出肿瘤相关基因中潜在功能区内的候选Indels，建立四色荧光复合扩增体系，结合多通道毛细管电泳实现Indels高通量分型。以肝细胞肝癌为模型，采用病例对照研究方法筛选出与HCC易感性相关的Indels。最后通过分子生物学方法及功能分析继续深入研究这些Indels在HCC发生发展过程中的分子机制。本项目有望进一步扩展Indels在肿瘤相关研究领域的应用，为最终阐明Indels影响肿瘤易感性的分子机理和设计特异性的肿瘤诊疗途径奠定基础。

微小插入缺失多态(Indels)广泛分布于人类基因组，其数量仅次于单核苷酸多态并已在肿瘤病因、药物设计等方面展现出巨大的应用前景。但由于缺乏高通量分型方法，Indels相关研究较其他遗传标记明显滞后。我们近期的研究表明，肿瘤相关基因中的Indels与肝细胞肝癌(HCC)发生存在显著性关联，获得了Indels参与HCC发生的可靠证据。本项目先后采用生物信息学方法筛选出肿瘤相关基因中潜在功能区内的候选Indels，以HCC为模型，采用病例对照研究方法筛选出位于RERT-LncRNA、KCNQ1OT1、lncRNA-GAS5、CD3G、SGSM3、PTPN11等基因中与HCC易感性相关的Indels。最后通过分子生物学方法及功能分析继续深入研究了这些Indels在HCC发生发展过程中的分子机制。实验结果表明，这些Indels可能通过影响转录子结合、microRNA结合、RNA空间构象等途径影响所在基因表达，进而参与HCC发生发展。本项目进一步扩展了Indels在肿瘤相关研究领域的应用，为最终阐明Indels影响肿瘤易感性的分子机理和设计特异性的肿瘤诊疗途径奠定了一定基础。