非综合征型唇腭裂易感基因编码和拷贝数变异的研究

Cleft lip and palate are the most common human cranial-facial birth defects. The interaction between environment and genetic factors contributes to the etiology of this complex disease and non-syndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) is the most common type. Although some abnormal chromosomal structure and susceptible genes have been identified to be associated with NSCL/P, the underlying genetic mechanism remains unknown. This project intends to investigate the coding variations and copy number variations of susceptible genes in Chinese Han core family with NSCL/P. The research proposals include: ① Screening exon mutations in already identified susceptible genes associated with NSCL/P; ②Analysis of copy number variation of NSCL/P by using CytoScanTM HD chips; ③ Using exome sequencing to find rare coding variations of NSCL/P unknown susceptibility genes; (4) In vivo and in vitro functional analysis of susceptible genes and dissecting the effects of mutations on gene function. This objective will faciliate our understanding of the pathogenic mechanisms of NSCL/P, providing the basis for genetic counseling and disease prevention, and improving the quality of birth population in our country.

唇腭裂是人类最常见的颅颌面出生缺陷，是一组在环境因素和遗传因素相互作用下发生的复杂疾病，非综合征型唇腭裂（NSCL/P）是最常见的类型，虽然已发现一些染色体结构异常和易感基因与NSCL/P相关，但其发病的遗传机制仍然不明。本项目拟对已收集的150个中国汉族人NSCL/P核心家系，开展以下研究工作：①对以往GWAS、Meta分析、动物模型颅颌面表达分析等研究发现的与NSCL/P相关的已知易感基因进行外显子突变筛查；②利用CytoScanTM HD芯片研究NSCL/P相关的拷贝数变异；③运用外显子组测序技术找寻NSCL/P相关的未知易感基因的稀有编码变异；④对新发现的易感基因进行功能分析，研究它们之间的相互作用及突变对功能的影响。通过本项目的研究，将进一步加深我们对非综合征型唇腭裂致病机制的认识，给临床遗传咨询和疾病预防提供依据，对优生优育和提高我国出生人口质量具有重要意义。

唇腭裂是人类最常见的颅颌面出生缺陷，是一组在环境因素和遗传因素相互作用下发生的复杂疾病，非综合征型唇腭裂（NSCL/P）是最常见的类型，虽然已发现一些染色体结构异常和易感基因与NSCL/P相关，但其发病的遗传机制仍然不明。本项目拟综合运用各种技术手段，开展以下研究工作：②中国汉族人群非综合征型唇腭裂易感基因研究；③基因多态性与中国汉族人群唇腭裂的易感性；另外新增了一项研究计划：④腭裂胎鼠羊水标志物的研究。通过本项目的研究，进一步充实了唇腭裂研究队列的建设，通过全基因组关联分析，发现了14个新的中国汉族人群唇腭裂易感位点，进一步证实了唇腭裂的表型异质性和人群异质性，分层分析的结果揭示了中国人群唇腭裂发病相关的环境因素，本研究不仅加深了对唇腭裂易感基因的认识，也为建立适合中国人群的唇腭裂孕前-围受孕期风险评价指标、预警模型和早期干预防控策略的制定提供依据，完成了既定的研究目标。