杂色鲍幼虫变态分子机制的转录组学分析

基本信息
批准号:41006105
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:22.00
负责人:王国栋
学科分类:
依托单位:集美大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王艺磊,邹志华,张丽莉,贾锡伟,葛辉,李维
关键词:
实时定量PCR芯片杂色鲍变态转录组幼虫
结项摘要

幼虫变态是鲍生活史中由浮游生活转为底栖生活的关键时期,对鲍的发育、生态分布和进化具有深远的影响。目前已知决定和影响幼虫附着变态过程的基因和信号分子种类和数量众多。但调控这一过程的分子网络和机制还尚未建立,缺乏对调控这一细胞过程的整体认识。最近快速发展的高通量测序技术以及实时定量PCR芯片技术为解析这一过程提供了技术途径。本课题将在已有的鲍cDNA文库、EST数据库的基础上,运用新一代高通量测序方法(Solexa)大规模测定杂色鲍面盘幼虫、"感受态幼虫"(competent larva)和变态后稚鲍的转录组并进行分析和功能注释,对有潜在意义的序列设计实时定量PCR引物,制备成高表征、高通量实时定量PCR芯片。运用该芯片分析杂色鲍幼虫在变态过程中基因表达谱,筛选与变态相关功能基因,并构建上述基因的相互作用网络,探讨杂色鲍幼虫变态的分子调控通路。

项目摘要

本项目完成了计划的所有目标。获得了杂色鲍幼虫转录子6.9万条,远远大于计划目标的8000条。通过比较3个发育阶段的表达谱,筛选了767条变态差异表达基因。用制备的实时定量PCR芯片获得了,获得了170多个重要变态候选基因的表达情况,其中包括胰岛素/胰岛素样生长因子信号通路、甲状腺激素信号通路及细胞凋亡通路等20多基因。根据上述获得表达结果,构建了杂色鲍幼虫变态相关基因表达谱系和相互作用网络。通过候选基因表达谱系的分析,发现幼虫神经系统的完善对于幼虫发育和变态具有重要作用。L-多巴、肾上腺素和谷氨酸等可能作为神经递质或内分泌激素发挥了重要作用。在变态过程中幼虫的能量需求可能维持在一个比较低的水平,机体整体上蛋白合成也处于较低的水平。甲状腺激素信号和胰岛素/胰岛素样生长因子信号通路通路参与幼虫的变态过程。其中IGFBP7表达时空模式及下调表达降低变态率,表明其可能是一个变态关键基因。这些过程的具体机制需要进一步研究,为以后研究指明的努力方向。本项目的部分研究结果已经整理发表了7篇学术论文,其中4篇被SCI收录,2篇核心期刊。在全国性会议上做口头报告6次。培养3名硕士生毕业。

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

岩石/结构面劣化导致巴东组软硬互层岩体强度劣化的作用机制

岩石/结构面劣化导致巴东组软硬互层岩体强度劣化的作用机制

DOI:10.3799/dqkx.2019.110
发表时间:2019
2

城市生活垃圾热值的特征变量选择方法及预测建模

城市生活垃圾热值的特征变量选择方法及预测建模

DOI:10.11936/bjutxb2021010011
发表时间:2021
3

基于链特异性RNA-seq的禾谷镰刀菌全生活史转录组分析

基于链特异性RNA-seq的禾谷镰刀菌全生活史转录组分析

DOI:10.13802/j.cnki.zwbhxb.2021.2021902
发表时间:2021
4

基于油楠(Sindora glabra)转录组测序的SSR分子标记的开发

基于油楠(Sindora glabra)转录组测序的SSR分子标记的开发

DOI:http://kns.cnki.net/kcms/detail/46.1068.S.20191231.1357.008.html
发表时间:2020
5

巴戟天抗去卵巢骨质疏松大鼠的血清代谢组分析

巴戟天抗去卵巢骨质疏松大鼠的血清代谢组分析

DOI:10.12360/cpb202104057
发表时间:2022

王国栋的其他基金

批准号:50734001
批准年份:2007
资助金额:170.00
项目类别:联合基金项目
批准号:91231108
批准年份:2012
资助金额:90.00
项目类别:重大研究计划
批准号:61305045
批准年份:2013
资助金额:23.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:41877075
批准年份:2018
资助金额:62.00
项目类别:面上项目
批准号:31070264
批准年份:2010
资助金额:36.00
项目类别:面上项目
批准号:31200902
批准年份:2012
资助金额:25.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:41501105
批准年份:2015
资助金额:24.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:81871814
批准年份:2018
资助金额:57.00
项目类别:面上项目
批准号:31460541
批准年份:2014
资助金额:50.00
项目类别:地区科学基金项目
批准号:91531303
批准年份:2015
资助金额:280.00
项目类别:重大研究计划
批准号:41802201
批准年份:2018
资助金额:26.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:31771556
批准年份:2017
资助金额:58.00
项目类别:面上项目
批准号:50227401
批准年份:2002
资助金额:90.00
项目类别:专项基金项目
批准号:31271575
批准年份:2012
资助金额:60.00
项目类别:面上项目
批准号:31470387
批准年份:2014
资助金额:85.00
项目类别:面上项目
批准号:11005113
批准年份:2010
资助金额:20.00
项目类别:青年科学基金项目

相似国自然基金

1

转录组学分析缺氧和高温应激下杂色鲍免疫防御机制

批准号:41176152
批准年份:2011
负责人:王艺磊
学科分类:D0604
资助金额:70.00
项目类别:面上项目
2

基于转录组学的杂色鲍早期发育关键阶段基因调控网络研究

批准号:40976093
批准年份:2009
负责人:陈军
学科分类:D0604
资助金额:49.00
项目类别:面上项目
3

皱纹盘鲍幼虫变态诱导剂研究

批准号:39370173
批准年份:1993
负责人:杨宇
学科分类:C2106
资助金额:6.00
项目类别:面上项目
4

脉红螺幼虫变态诱导机制及变态过程的调控机理

批准号:31572636
批准年份:2015
负责人:张涛
学科分类:C1906
资助金额:64.00
项目类别:面上项目