荧光检测灵敏度低是DNA芯片等核酸荧光分析技术的主要缺点。利用聚合酶及反转录酶将染料标记的底物Dye-dNTP直接导入DNA,可望大大提高灵敏度,但受到酶对Dye-dNTP相容性差的制约。本项目改变探针分子设计思路,提出用最易转动的柔性醚键链连接dNTP-炔丙基与染料基,同时在染料分子上引入多个净负电荷。其主要功能为:①消除染料与DNA碱基疏水部位的亲和力;②增大染料与DNA链上磷酸酯阴离子间的静电排斥作用,使染料基团远离DNA主链;③醚柔性链可减弱Dye-dUTP/酶/模板在空间取向调节中的阻碍,增加酶与Dye-dUTP的有效结合,增大酶导入荧光底物的效率;④染料上多个负电荷,还可增大标记到DNA链上的染料间的静电排斥力,从根本上消除疏水性染料相互聚集而产生的荧光淬灭,从而真正做到荧光强度随染料引入量的增加而增强。项目的完成可望得到比引物标记法高1-2个数量级的荧光检测灵敏度。
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数据更新时间:2023-05-31
DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences
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