基于12号染色体候选区域的家族性精神分裂症易感基因定位与鉴定

基本信息
批准号:81171265
项目类别:面上项目
资助金额:14.00
负责人:曾丽苹
学科分类:
依托单位:中国人民解放军第二六一医院
批准年份:2011
结题年份:2012
起止时间:2012-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:李恺,樊中华,郑永军,王国良,王大鹏,梅桂森,杨叶芃,贾梅志,张瑛雪
关键词:
精神分裂症易感基因外显子捕获重测序
结项摘要

精神分裂症是最常见且严重的精神疾病,不仅严重危害人类健康并带来巨大社会负担。遗传因素是精神分裂症最主要的致病因素,寻找易感基因已成研究热点。我们前期在国家自然科学基金资助下,对一个精神分裂症高发大家系,应用全基因组扫描、参数和非参数连锁分析,将易感基因精细定位在12号染色体12p12-q13的全新区域,大约400个基因。但使用传统方法逐个测序定位易感基因费时费力。新发明的外显子捕获和第二代测序是高通量革命性技术,可以快速、高效、全面的筛查易感基因。本课题拟利用上述平台靶向捕获该精神分裂症大家系先证者及主要成员的12号染色体全部外显子序列富集后进行重测序,结合家系单体型分析,力争找到关联最大的易感基因;进而在家系内部、另外15个家系及正常对照中进行验证,生物信息学预测编码蛋白结构和功能变化,力求阐明基因型和表型关系,将有助于理解这些基因对精神分裂症的作用,为该病早期诊断和治疗提供依据。

项目摘要

[摘要] 遗传因素是精神分裂症最主要的致病因素,寻找易感基因已成研究热点。我们前期在国家自然科学基金资助下,对一个精神分裂症高发大家系,应用全基因组扫描、参数和非参数连锁分析,将易感基因精细定位在12号染色体12p12-q13的全新区域,大约400个基因。但使用传统方法逐个测序定位易感基因费时费力。新发明的外显子捕获和第二代测序是高通量革命性技术,可以快速、高效、全面的筛查易感基因。本课题利用上述平台靶向捕获该精神分裂症大家系先证者及主要成员的全外显子组序列富集后进行重测序,结果如下:总变异数:268,307 SNPs ,32,127 Indels 。根据数据筛选原则,去掉已知高频位点 MAF > 0.01 in dbSNP 135,去掉无已知生物学意义的位点,结果总变异数为127,去掉单纯knownSNP、consScoreGERP>2和CpG,为49,错义突变20/49。基因排序第一的是尿皮素(UCN)基因。检索出的文献报道,UCN可能与焦虑、抑郁、精神分裂症相关。因此UCN可能是精神分裂症的易感基因。需下一步的验证结果证实。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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