山楂（C. pinnatifida Bge.）黄酮性状的关联分析及功能标记研究

山楂（C.pinnatifida Bge.）是我国特有的果树种类之一，同时山楂也是一种重要的药用植物资源，山楂中含有丰富的黄酮成分具有极大的开发研究价值，从基因组水平上研究黄酮表型差异的分子机理，并充分挖掘和利用我国山楂珍贵的基因资源具有重要的理论和实践意义。本研究以遗传基础广泛的山楂种质资源群体为试材，利用AFLP和SRAP分子标记技术分析该群体的连锁不平衡水平及群体结构特征，并对该群体查尔酮合成酶基因（CHS）区段进行序列多态性分析，采用全基因组扫描和候选基因途径两种策略对山楂黄酮性状进行系统的关联遗传学分析，发掘相关的QTL位点及高特异性的SNP标记，并筛选出优异等位基因及其载体材料。研究结果为今后开展分子标记辅助选择、相关基因分离及黄酮性状遗传改良等研究奠定基础。也为多年生木本植物的数量性状遗传研究提供新思路。

本项目以国家山楂资源圃收集的资源为试材，针对山楂中重要的药用成分黄酮含量，采用全基因组扫描和候选基因两种策略对山楂黄酮性状进行系统的关联遗传学分析，得出以下结果：（1）建立和优化了山楂SSR、SRAP、AFLP分子标记技术体系；（2）利用SSR、SRAP、AFLP分子标记技术开展山楂自然群体的连锁不平衡分析，黄酮单体的关联分析，明确了山楂的群体结构，获得了和黄酮含量显著关联的QTL位点70个，极显著关联的位点23个；（3）利用高效液相色谱技术精确测定了122份山楂资源的黄酮单体含量，从中筛选获得了27份高黄酮含量资源，为山楂资源的利用提供参考；（4）选择黄酮代谢途径中关键酶基因-查尔酮合成酶基因（CHS）作为候选基因，参考近缘物种的序列信息，开展查尔酮合成酶基因（CHS）的关联分析，目前已完成山楂资源的CHS测序分析。