我国一种新发现的沙粒病毒与人类疾病关系的研究

We found that there are the new genotypes of Arenavirus（ARV）in the dominant rodents (Rattus tanezumi and Rattus norvegicus) in residential areas in Yunnan Province, China and the genomes of the five strains of ARV have been sequenced. It is discovered that ARV harbored by rodents in Yunnan province is the most similar to that of Wenzhou virus reported in Wenzhou city, Zhejiang province, China. There is no any case infected with ARV except lymphocytic choriomeningitis virus in China. It was detected that the antibody against ARV among patients with unknown fever in Yunnan province. The hosts (R. tanezumi and R. norvegicus) are the dominant rodents in residence community distributed all over Yunnan province and their activities are very closely related to production and living of human. So it is necessary to perform a system research on ARV harbored by the hosts (R. tanezumi and R. norvegicus). On the basis of previous work, this study makes further investigation on the infected situation, genetic variation of ARV, and the evolutionary relationships among the ARV and hosts. The study reveals the pathogenicity of ARV to human for providing technical guidance of surveillance, control and prevention of ARV in Yunnan province.

申请人前期在云南居民区生活的优势鼠种—黄胸鼠和褐家鼠中发现存在着一类沙粒病毒的感染，完成了5株沙粒病毒的全基因组测序，比较发现这种沙粒病毒与浙江发现的温州病毒最为相似。在不明原因发热病人血清中检测到这种病毒的抗体，提示这类沙粒病毒可感染人。而我国至今除淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒外，没有其它沙粒病毒感染人的病例报道。黄胸鼠和褐家鼠是云南居民区活动的优势家鼠，分布范围广，与人的关系十分密切。因此，有必要对这2种优势家鼠所携带的沙粒病毒开展系统的研究。本研究是在前期工作的基础上，进一步调查这类沙粒病毒的感染现状、遗传变异以及病毒与宿主动物的进化关系；阐明该类病毒与人类疾病的关系，为沙粒病毒的监测、预防和控制提供科学指导。

背景：沙粒病毒可导致人类致命的病毒性出血热，引起人们的高度关注。云南省居民区的黄胸鼠和褐家鼠中存在一类沙粒病毒的感染，与人的关系十分密切。有必要对这2种优势家鼠所携带的沙粒病毒开展系统的研究。研究内容：调查这类沙粒病毒的感染现状、遗传变异以及病毒与宿主动物的进化关系，阐明该病毒与人类疾病的关系。结果：对云南省18个县（区）采集的21属46种3654只小型哺乳动物进行了沙粒病毒检测，感染率为2.24%（82/3654），其中褐家鼠感染率为10.94%（73/667）、黄胸鼠为0.65 %(7/1081)、大足鼠为5.26%（1/19）、大耳姬鼠为6.70%（1/15）和树鼩为4.00%（1/25）。42株来自元谋县，33株来自泸西县，6株来自宜良县，1株来自德钦县。获得5株沙粒病毒基因组。通过遗传进化分析：云南省小兽中检测到的沙粒病毒为温州病毒的不同亚型，L片段核苷酸相似性85.10%-87.20%，S片段相似性81.80-88.30%。实时荧光定量RT-PCR测定了沙粒病毒感染宿主动物的心、肝、脾、肺、脾和直肠组织，病毒载量5.10×108 -1.14×1011拷贝/克，其中心、肝和肺病毒载量高。病理学研究，温州病毒对宿主致病性弱。在昆明、大理、楚雄、红河、德宏、怒江、丽江、迪庆8个州、市采集不明发热病人血清2227份，通过血清流行病学调查，酶联免疫吸附实验温州病毒IgG阳性率为2.33%，其中楚雄州元谋县阳性率6.54%，红河州泸西县4.92%，大理州祥云县3.82%，德宏州瑞丽市16.67%，蛋白印迹实验该病毒抗体阳性率为0.23%，假病毒中和实验该病毒抗体阳性率为0.18%。通过沙粒病毒核酸检测上述不明发热病人血清和元谋县、泸西县、祥云县正常人群咽拭子620人份，皆为阴性。证实云南省存在人感染温州病毒病例，但感染率较低。科研意义:为沙粒病毒的监测和防控提供科学指导。