矮牵牛DUF620蛋白家族基因PhADR1的功能及调控机理解析

基本信息
批准号:31501801
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:21.00
负责人:阳永学
学科分类:
依托单位:武汉市农业科学院
批准年份:2015
结题年份:2018
起止时间:2016-01-01 - 2018-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:张雪丽,赵志远,祝菊红,邢景景,周琴
关键词:
矮牵牛调控机理功能分析PhADR1DUF620蛋白家族
结项摘要

DUF620 protein family is an important member of domains of unknown function (DUF) protein families. At present, function of most genes is not very clear in DUF620 protein family. Our previous study suggested AtADR1 (locus At5g05840) is likely related to anther dehiscence in Arabidopsis. AtADR1 is a member of DUF620 protein family. The sequence of AtADR1 was cloned from petunia. The bioinformatic analysis suggested that PhADR1 is the homologous gene of AtADR1. PhADR1 was shown to be expressed preferentially in buds in petunia. To investigate the biological function and regulatory mechanism of PhADR1, firstly, the RNAi vector and over-expression vector of PhADR1 will be constructed and transformed with petunia to study the function of PhADR1. Secondly, the spatial and temporal expression pattern of PhADR1 will be studied by RNA in situ hybridization and promoter activity assay of PhADR1. Thirdly, subcellular localization of PhADR1 will be performed with gene gun bombarding into onion epidermal cell. Finally, the interaction proteins of PhADR1 will be screened using yeast two hybrid system and protein interactions will be verified in petunia using bimolecular fluorescent complementation (BiFC). The implementation of the project could not only clarify the biological function and regulatory mechanism of PhADR1 in petunia, but also help to illuminate the function and evolution of members of the DUF620 family in different species and provide a scientific basis for the rational application of PhADR1 in quality improvement of ornamental plants. Thus, this project will has important scientific significance in both theory and practice.

DUF620 蛋白家族是未知功能结构域(DUF)蛋白家族的重要成员,目前,该家族绝大多数基因的功能尚不清楚。我们前期研究发现,拟南芥DUF620 蛋白家族一个功能未知的基因AtADR1(At5g05840)可能与花药开裂相关。克隆获得的矮牵牛AtADR1同源基因PhADR1在花蕾中高量表达。本项目拟构建PhADR1 RNAi和超表达载体,转化矮牵牛,研究其功能;采用RNA原位杂交和启动子活性检测研究PhADR1时空表达模式;通过基因枪转化洋葱表皮细胞研究PhADR1亚细胞定位;采用酵母双杂交筛选PhADR1互作蛋白,并通过双分子荧光互补(BiFC)在矮牵牛中验证蛋白互作。项目的实施,不仅可以明确矮牵牛PhADR1基因的功能及调控机理,将有助于揭示DUF620家族成员在不同物种中的功能与进化,而且为PhADR1在观赏植物品质改良中的合理利用提供科学依据,具有重要的科学意义和实用价值。

项目摘要

未知功能结构域(Domains of Unknown Function,DUF)蛋白家族是一大群并未表征功能的蛋白家族,其蛋白结构中包含至少一个高度保守的DUF结构域。近年来的研究表明,一些DUF蛋白调控植物的生长发育,一些DUF蛋白参与调控植物对逆境胁迫的响应,还有一些DUF蛋白既在植物生长发育中起着重要的作用,也在植物逆境胁迫响应中发挥着作用。DUF620家族是DUF 蛋白家族的重要成员之一,大多数DUF620蛋白家族成员的功能尚不清楚。矮牵牛是重要的观赏植物,也是花发育的模式植物,明确DUF620蛋白家族基因的功能将为植物分子育种提供新的基因资源和理论支持。本研究从矮牵牛中克隆了PhADR1、PhDUF1和PhDUF2 三个DUF620 蛋白家族基因;通过qPCR 对PhADR1的表达特征进行分析,对PhDUF1和PhDUF2 在不同非生物学胁迫中的表达进行分析;通过转化拟南芥和烟草,证明PhADR1在植物花药开裂中发挥重要作用,PhDUF1参与植物根系发育和非生物胁迫反应。本研究一方面可以加深DUF620蛋白家族基因的在植物发育和非生物胁迫中的功能和调控机制认识,另一方面为DUF620蛋白家族基因在观赏植物品质改良中的合理利用提供科学依据。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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