儿童急性呼吸道感染中新型鼻病毒（HRV-C）基因变异性研究

急性呼吸道感染发病率占所有急性传染病的首位，并已成为导致5岁以下儿童死亡的第二大病因，是儿童的主要公共健康问题之一。研究表明儿童急性呼吸道感染的病原体仍以病毒为主。申请人研究前期工作证实鼻病毒具有较高的感染率，同时存在新发现的C群，并为主要流行群，本研究采用RT－PCR和PCR方法检测常见呼吸道病毒RSV、HRV、IFV(A、B型)、PIV(I,II,III型)、ADV及新发现可能与呼吸道疾病相关病毒HMPV、HBOV,HCoV-NL63、HCoV-HKU1，同时进一步建立鼻病毒C群VP1片段扩增方法，目标在了解上海地区儿童急性呼吸道感染病毒病原谱的基础上，基于前期鼻病毒 VP4/VP2片段研究的基础，进一步延伸对于变异性更大的VP1片段进行相关研究，了解不同地区VP1变异情况，为进一步进行抗药性研究提供数据。

人鼻病毒是引起呼吸道感染的最常见病原，既往基于基因的遗传进化分析将HRV分为HRV-A和HRV-B两个群。2007年发现新的基因型HRV-C,目前对这种新发病毒了解较少。本研究期望了解上海地区HRV-C的临床及分子流行病特征及HRV-C变异情况，监测该地区儿童急性呼吸道感染的病毒病原谱，了解不同病毒的临床及分子流行病特征。我们收集2012年1月至2013年12月，在上海交通大学医学院附属第三人民医院，新华医院，普陀区中心医院因急性呼吸道感染就诊的643例患儿的鼻咽抽吸物标本，采用RT-PCR和PCR方法检测HRV、RSV、IFV(A、B型)、PIV(1-4型)、HMPV、HCoV-NL63, HCoV-HKU1、ADV、HBoV，并且分别采用RT-PCR和巢式PCR扩增HRV VP4/VP2基因片段和VP1基因片段，并对所有阳性产物并进行序列测定。本研究收集标本中，共检出病毒感染阳性标本369份，总检出率57.4%，其中HRV 检出率12.4%, RSV检出率12.9%, IFVA检出率1.1 %, IFVB检出率2.5% , PIV1检出率3.3%, PIV2检出率0.7%, PIV3检出率9.5%, PIV4检出率3.9%, ADV检出率15.3%，HMPV检出率4% , HBoV检出率10.2%, HCoV-HKU1检出率1.1%, HCoV-NL63未检出。HRV-C检出率3.3% ，核苷酸同源性在93％～100%之间. HRV-C有9例混合感染,其中5例混合感染HBoV，HRV-C年龄为2个月~3岁，中位年龄为9个月，所有患儿年龄均小于3岁。HRV-C的检出高峰出现在10月，临床诊断均为下呼吸道感染，临床症状无特异性，主要包括发热，咳嗽，咳痰，咽充血，喘息，肺部可及啰音或哮鸣音，部分伴有腹泻。本研究从80例HRV阳性标本中扩增出52例VP1基因片段，建立了HRV VP1片段扩增方法。本研究各阶段按计划进行，目前发表论文3篇。