苎麻遗传连锁图谱构建及纤维品质相关性状QTL定位

作为我国的特色产品，苎麻纤维以其独特的优点和用途在国民经济中起着不可缺少和替代的重要作用。但由于苎麻的分子遗传图谱构建及性状的QTL定位至今空白，影响了分子标记辅助选择在苎麻育种中的应用，纤维品质改良缓慢。为此，本研究在设计开发SSR引物的基础上，拟利用两个纤维品质差异大的苎麻品种作为亲本构建F1分离群体，采用拟测交策略构建苎麻的SSR、ISSR 、SRAP、AFLP分子标记遗传连锁图谱，筛选出与苎麻纤维品质相关性状连锁的分子标记，定位苎麻纤维品质相关性状的QTL，为了解苎麻的分子遗传奠定基础，进而在苎麻育种中进行分子标记辅助选择，提高选择准确性，加快育种进程。

作为我国的特色产品，苎麻纤维以其独特的优点和用途在国民经济中起着不可缺少和替代的重要作用。但由于苎麻的分子遗传图谱构建及性状的QTL定位至今空白，影响了分子标记辅助选择在苎麻育种中的应用，纤维品质改良缓慢。为此，本研究在设计开发EST-SSR引物、通用SSR和评价RSAP标记的基础上，利用两个纤维品质差异大的苎麻品种中苎1号和合江青麻作为亲本构建F1分离群体，采用joinmap3.0构建苎麻的SSR、SRAP、RSAP分子标记遗传连锁图谱，筛选出与苎麻纤维品质相关性状连锁的分子标记，定位苎麻纤维品质相关性状的QTL。结果表明:(1)从320对苎麻EST中开发了76对SSR引物。其中，70对引物进行了有效扩增，50对引物具有多态性，27对引物扩增出了清晰条带。利用popgene32软件，考察了27对引物的遗传多样性。27对SSR引物中，每对引物扩增的位点数在2-5之间，其中19对引物扩增出2个位点，7对引物扩增出3个位点，1对引物扩增出5个位点。27对引物的观察杂合度（HO）在0.16到0.93之间，期望杂合度在0.21到0.66之间。14对引物偏Hardy–Weinberg(P < 0.05).另外，还发现45对棉花SSR引物可以在苎麻上利用。（2）在检测苎麻种质亲缘关系中，SRAP标记效果最优，RSAP标记稍逊，SSR标记最差。RSAP标记能较好地显示苎麻种属间的多态性和亲缘关系。以RSAP、SRAP、SSR标记联合分析，能更好地揭示种质之间的亲缘关系。（3）采用中苎1号x合江青麻F1分离群体的180个单株，利用JoinMap3.0软件对417个SSR、RSAP和SRAP标记进行分析后，得到了一张包含63个连锁群的苎麻遗传图。该图谱包含200个标记，其中 RSAP 标记121个，SSR标记56个，SRAP标记23个。标记间的最大图距为49 cM，最小图距为0cM，平均图距为16.2cM，图谱覆盖基因组的总长度2221cM。（4）利用mapQTL5.0复合区间作图法和单标记分析法，分别定位了3个（LOD>2.5）和2个(P<0.01)纤维细度QTL。其中检测到的1个QTL贡献率高达50%，暗示该QTL具有较大的利用价值。以上研究结果，为分子标记辅助育种提供了有价值的信息，奠定了苎麻纤维细度分子辅助选择基础。