新疆维吾尔族、哈萨克族、汉族非综合性唇腭裂的分子流行病学研究

NSCL/P是一种口腔颌面部常见先天畸形，确切病因尚不清楚，大多认为是由多种基因和环境因素共同作用的结果。目前国内外大多研究集中在某个特定环境或种族背景下进行的，这些研究虽也发现一些易感基因或位点，但这些基因或位点难以得到一致的重复验证。新疆是一个多种族共同生活的地区，各民族生活习惯、饮食习惯、经济文化等方面殊异， 因此为研究NSCL/P 提供了独特的基因和环境样本资源。本项目运用分子流行病学方法，利用飞行质谱技术检测维、汉、哈族中TGF-A、TGF-β3、IRF6、MSX-I、MTHFR基因的SNPs序列变异；通过PCR-DGGE法研究基因在患者是否发生突变；应用病例-对照设计，对环境和基因多态性与NSCL/P的关系进行交互作用分析；通过RT-PCR检测筛选易感基因的表达情况，探讨基因和环境因素协同引起维、哈族NSCL/P高发的可能机理，为该病的发病机制及防治提供一些有价值的参考资料

NSCL/P 是一种口腔颌面部常见先天畸形，确切病因尚不清楚，目前国内外大多研究集中在某个特定环境或种族背景下进行的，缺乏同一地区相同背景下不同民族人群分子遗传学变异资料。本课题采用高通量的飞行时间质谱检测技术和Snapshot技术检测了新疆维吾尔族、哈萨克族和汉族人群中7个候选易感基因11个位点的SNPs序列变异，应用病例-对照研究、传递不平衡检验分析方法，分别进行单个的SNP位点及多个SNPs位点(单倍型)与NSCL/P之间的关联性分析，研究结果表明1、IRF6基因rs2235375位点G等位基因，MSX-I基因 rs3821949位点G等位基因，MTHFR基因C677T位点T等位基因和A1298C(rs1801131) A1298C位点C等位基因，PVRL2基因 rs2075642位点A等位基因与维吾尔族非综合征型唇腭裂存在强的相关性；2、IRF6基因 rs2013162位点A等位基因，MSX-I基因rs12532位点G等位基因，SUMO1基因 rs7580433位点A等位基因与哈萨克族非综合征型唇腭裂存在强的相关性；3、IRF6 基因rs2235375位点G等位基因，MSX-I基因rs12532位点G等位基因与汉族非综合征型唇腭裂存在强的相关性。MTHFR基因的两个位点（rs1801131和 rs1801133）在维吾尔族和哈萨克族均存在连锁关系。应用病例一对照设计，对环境暴露因素和候选易感基因多态性与NSCL/P的关系进行单因素X2分析和多因素Logistic回归分析，首次比较分析维吾尔族、哈萨克族NSCL/P高发的，以及与环境交互作用后引起表型改变的遗传学研究结果表明4、孩子性别（男性）、母亲文化程度低、孕期感冒、孕期（或孕前）贫血状态、父亲吸烟、携带MTHFR基因rs1801131 AC+C突变型、IRF6基因rs2235375 CG+GG突变型可能是新疆维吾尔族NSCL/P发病的危险因素，它们协同增加维吾尔族NSCL/P罹患风险。5、父亲吸烟、孕期感冒、孕期（或孕前）接触农药状态、父亲饮酒、IRF6基因rs2235375CA+A突变型、 SUMO1 rs7580433 AG+A突变型，可能是新疆哈萨克族NSCL/P发病的危险因素( P＜0.05)，它们协同增加哈萨克族NSCLP罹患风险。