中国土壤中暗色丝孢菌疑难属种的分子生物学鉴定

采用已被证明对真菌属、种级分类较为有用的几个基因位点，如rDNA-ITS、?-tubulin、Brn1、rpb1、rpb2等的综合序列分析技术，对已经分离获得的65个左右中国土壤暗色丝孢菌疑难种及其形态近似种，进行分子生物学鉴定；对于获得分离物和种数较多的属，如齿梗孢属Scolecobasidium、矛束霉属Doratomyces、腐质霉属Humicola、漆斑霉属Myrothecium等，在分种界定的基础上，用已获得的我国分离物的及GenBank中同属种的分子信息，进行属内种间关系的分子系统学分析；对于存在争议的矛束霉属Doratomyces和毛束霉属Trichurus之间的界限、是否应该合并等问题，进行分子生物学界定；在时间和工作量容许的情况下，对于本研究室近年发表的，根据传统分类标准可以肯定的一些土壤暗色丝孢菌新种，通过多基因位点分析，增加分子信息，加深对于其遗传本质的理解。

对近年来从我国土壤中分离获得的65个暗色丝孢菌疑难种及其相关属、种（共72种），在形态分类的基础上，选ITS、LSU和SSU三个基因片段，进行测序和分析。对获得种数较多的Cephalotrichum、Gliomastix、Humicola、Scolecobasidium和Scytalidium等五属进行了较集中的研究分析。 据分子系统学研究结果，得出Trichurus不应作为一个独立的属存在，而应作为Cephalotrichum属名下的的一个亚群的结论。三基因片段的序列分析结果与部分疑难种的形态分类结论是一致的，从而加强了它们作为新种的分类地位。序列分析结果同时与另一些疑难种的形态分类结论是不一致的，表明所测分子性状与形态分类性状并非对应关系，只要形态分类性状是明确而稳定的，应以形态分类研究结果为准，供试基因片段研究结果作为有益的补充。现代真菌分类应该是在充分运用和发展形态、生理、生化等传统分类方法的基础上，尽量采用现代分子生物学研究技术和理论的综合分类研究方法。