银屑病与系统性红斑狼疮共同易感基因TNIP1和TNFAIP3基因精细定位研究

基本信息
批准号:31160192
项目类别:地区科学基金项目
资助金额:47.00
负责人:韩建文
学科分类:
依托单位:内蒙古医科大学
批准年份:2011
结题年份:2015
起止时间:2012-01-01 - 2015-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:乌日娜,于希军,吕新翔,王勇,李东霞,李艳,王杰
关键词:
银屑病TNAIP3系统性红斑狼疮精细定位TNIP1
结项摘要

遗传和免疫异常在银屑病和系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)的发病中都起到重要的作用。近年来,通过银屑病和SLE的全基因组关联分析研究发现TNIP1和TNFAIP3基因与两种疾病都具有关联性,而且在不同的人种中得到证实。课题组负责人及部分成员作为主要参与人参加了中国人群银屑病和SLE的全基因组关联分析系列研究。在前期研究结果基础上,本项目拟对TNIP1和TNFAIP3基因进行精细定位,构建影响银屑病、SLE易感性的危险单倍型,寻找真正影响疾病的易感遗传变异,分析基因-基因交互作用对两种疾病的影响。检测患者及正常对照血清中的TNIP1和TNFAIP3以及肿瘤坏死因子α(TNF-α),明确在TNIP1和TNFAIP3在蛋白水平对两种疾病的影响。该项研究将为深入理解银屑病、SLE的遗传易感性,为阐明疾病的发病机制、疾病风险预测和诊断治疗提供理论依据。

项目摘要

遗传因素在银屑病和系统性红斑狼疮(SLE)的发生中有着重要的作用。TNIP1 和TNFAIP3 基因与两种疾病都具有关联性。在前期研究结果基础上,本项目分步骤对银屑病、SLE遗传易感性进行系列实验研究。共收集寻常性银屑病1000余例,健康对照1300余例、系统性红斑狼疮284例。先后对187个SNP进行基因分型,样本量达到1521例。利用PLINK1.07软件和Haploview软件进行统计分析。主要研究内容及结果:.1、在TNIP1基因多态性与寻常型银屑病相关。rs17728338等位基因频率在寻常性银屑病组及各型(早发型、晚发型、有家族史、无家族史)病例组均显著高于对照组(均P<0.0167)。.2、TNIP1基因区域5个SNP与GPP相关(P<8.33× 10-3),一个危险单倍型(ACGAAC)与GPP明显相关。OR达到4.16(P=4.46× 10-7).3、TNIP1基因区域有5个SNP与SLE相关。对这5个SNP进行单倍型分析,结果显示,危险单倍型(CCCGT)在病例组中的频率(0.290)高于对照组(0.210),差异有统计学意义(P < 4.72 × 10−4)。.4、TNIP1基因区域有13个SNP显示与SLE相关。一个危险单倍型(GCCCGTGTCATGG)与SLE显著相关,覆盖TNFAIP3基因区域约29kb(P=1× 10-4)。.5、对35个银屑病相关基因变异进行验证实验,证实了ERAP1基因突变、GJB2突变、REL基因变异与寻常型银屑病的相关性(P<0.0167)。.6、对GPP进行IL-36RN基因测序,发现基因4个突变。c.115+6T>C、p.Pro76Leu在脓疱性银屑病中突变的频率明显高于正常对照。.7、银屑病患者血清中IL12、IL23表达水平高于对照(P<0.01),而在SLE中与对照间无显著差异(P>0.05)。IL12与IL23呈正相关(P<0.01,R=0.676)。银屑病组血清TNF-α、IL-8水平显著高于对照组(P<0.05)。TNF-α与IL-8呈正相关(P<0.01, R=0.812)。.该项研究发现了一系列银屑病、SLE的遗传易感变异和单倍型,并且在银屑病、SLE血清中细胞因子表达量与对照有显著差异。这些研究成果将为深入理解银屑病、SLE 的遗传易感性,为阐明疾病的发病机制提供理论依据。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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