中国汉族人群冠心病相关拷贝数变异的鉴定

寻找冠心病致病基因是全球的热点和难点，拷贝数变异（copy number variation, CNV）是最新发现的人类基因组变异形式并参与复杂性疾病进程。本课题立足中国汉族人群,(1)应用生物信息学方法并结合最新CNV图谱和基因组图谱，识别冠心病定位区域内CNV、SNP及涉及基因；(2)应用全基因组芯片平台在小样本冠心病患者中初筛验证比对，构建中国汉族人群冠心病候选CNV条目；(3)从功能候选的角度，先期挑选10个CNV，在首轮1000例冠心病和冠脉正常对照人群中，经定量PCR体系开展关联研究，评估候选CNV对冠心病临床表型及中间表型的风险；(4)应用寡核苷酸芯片平台，对有统计学意义的CNV检测其定位区域内单体型标签SNP的等位基因拷贝数。研究将可能识别冠心病相关基因及CNV，为冠心病的发病机制、风险预测和诊断治疗提供理论依据，为多基因疾病研究探索新思路。

冠心病是一种发病率、患病率和死亡率极高的多基因疾病，由遗传因素和环境因素交互作用而发病，寻找冠心病的致病基因是全球的热点和难点。本项目以中国华东地区汉族为研究对象，通过构建大样本的冠心病及冠脉正常对照人群的表型库、中间表型库和基因组DNA库，应用生物信息学方法并结合最新CNV图谱和基因组图谱，以第四代遗传标记－拷贝数变异（CNVs）结合第三代遗传标记－单核苷酸多态（SNPs）为研究手段，关注冠心病全基因组关联研究中有统计学意义的基因定位区域，从脂蛋白加工、内皮完整性、血管免疫炎症和血栓形成四大通路为切入点，通过功能候选，仔细识别该些区域内CNVs、SNPs及涉及基因，重点对LPA，MEF2A，Apelin/APJ,LTA，IL6等基因开展病例-对照关联研究，评估候选CNVs，SNPs及其单倍型对冠心病临床表型及中间表型的风险。研究获得了一系列中国人群特有的冠心病遗传标记，为冠心病的发病机制、风险预测和诊断治疗提供理论依据，为多基因疾病研究探索新思路。