应用新建立的猪寡聚核苷酸基因芯片技术分离基因组中新的印记基因

在申请人已结题的国家基金研究中克隆了猪SDHD基因的cDNA序列并进行了基因定位，发现外显子中的一个碱基变异与眼肌面积有显著关联。该基因在人中被认为可能存在印记效应。本研究将利用这些已经发现的SNP信息，研究该基因是否在猪中存在印记效应，并扩大研究范围，利用刚建立的13000个基因的猪寡聚核苷酸芯片技术，结合DNA甲基化与碱基突变检测，与人和小鼠中的生物信息进行比较功能与结构基因组学研究，找到在猪肌肉与胎盘中表达的与人和小鼠印记基因丰富存在的染色体区域的同源基因，并进行基因组印记鉴定，进一步分离猪基因组中新的印记基因。在本室基地的试验猪群中进一步对确定有印记现象的基因进行与产肉及繁殖性状的相关研究。本项目率先在猪中应用DNA芯片技术进行印记基因检测，并进一步分离具有我国知识产权的猪基因组中新的印记基因。研究结果将为改善传统的猪育种方式注入新思路。