特异茶树花不育机理研究与分子标记开发

基本信息
批准号:31460216
项目类别:地区科学基金项目
资助金额:50.00
负责人:梁名志
学科分类:
依托单位:云南省农业科学院
批准年份:2014
结题年份:2018
起止时间:2015-01-01 - 2018-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:陈林波,唐一春,夏丽飞,包云秀,孙云南,肖星
关键词:
功能鉴定分子标记开发茶树花不育机理转录组测序
结项摘要

Tea was the plant only uses leaves. The purpose of cultivation was to obtain their vegetative organs-bud leaves. The flourish prosperous tea branches and leaves are the precondition for the high and stable yield. However, the reproductive growth could reduce its own vegetative growth, speed up aging, reduce the yield and quality. Therefore, research on sterility mechanism and exploitation of molecular markers of sterility gene will help tea germplasm enhancement, variety improving and provide a theoretical basis and practice foundation for the tea production and breeding. In this project, the transcriptome of normal flowers (male parent, female parent) and sterility flowers (offspring) are deeply sequenced through RNA-seq technology. After that, the differential expression patterns of these three samples were determined by the digital gene expression profile and the different gene quantity, variety and function were analyzed; screening and full length cDNA cloning of sterility genes and the expression characteristics by quantitative PCR are also performed; the SSR and SNP analysis is produced to exploit the SSR and SNP markers for sterility genes. Through these studies, we can enrich the tea tree transcriptome, illustrate the sterility mechanism and also provide the basis materials and theoretical foundation for the breeding, gene exploitation and heterosis research of the infertility tea species.

茶树是叶用植物,茶树栽培的目的是收获其营养器官--芽叶。茶树枝叶生长繁茂是茶园高产、稳产的前提。但是,生殖生长会抑制茶树的营养生长、加速茶树的衰老,降低茶叶产量与品质等。为此,开展茶树花不育机理研究,开发不育基因的分子标记,揭示茶树不育奥秘,将有助于茶树种质创新、品种改良以及解决一系列育种、生产实践问题提供科学依据和理论基础。本项目拟采用RNA-seq技术分别对正常花(父本、母本)、不育花(子代)进行转录组测序,一是对3个样本转录组进行数字基因表达谱分析,研究差异基因的数量和种类;二是筛选不育基因并进行全长cDNA克隆与功能鉴定,同时利用荧光定量PCR研究其表达特征;三是对转录组数据进行SSR以及SNP分析,开发不育基因的SSR标记以及SNP标记。通过这些研究,不仅丰富了茶树转录数据、阐明了茶树不育机理,而且为不育茶树品种辅助选育、新基因发掘以及杂种优势研究提供基础材料和理论依据。

项目摘要

花既是茶树繁育后代的重要器官,同时,对于利用芽叶的茶树来说,开花结果也是影响茶叶产量和品质的重要因素。因此,开展茶树不育机制研究具有重要理论意义和实践价值。本项目选用福鼎大白茶(父本)、佛香2号(母本)及其杂交后代(不育)茶树花为材料,一是采用RNA-seq技术完成了父本花、母本花以及子代不育花花蕾的转录组测序和miRNA测序,获得204 199条Unigene,以及鉴定出55种已知的miRNAs和90种新的miRNAs,并完成Unigene的功能注释和miRNA靶基因的功能分析;二是利用数字基因表达谱技术分析了父本花、母本花以及子代不育花花蕾的转录组差异和miRNA差异,筛选出在父本花与子代不育花、母本花与子代不育花共有而在父本花与母本花没有的差异基因1 219条、差异miRNA 37个,对差异基因以及差异miRNA分析发现生长素合成和生长素信号转导是影响茶树花不育的重要原因;三是克隆了茶树花发育相关的ARF9、YUCC10、AGL9基因,并对表达模式进行了分析,为后续基因的功能验证以及阐明茶树花不育机制奠定基础;四是分析了父本花、母本花以及子代不育花中色氨酸(生长素合成的前体物)和生长素含量,发现不育花中的色氨酸明显高于其父本和母本花,分别是父本和母本的339%和478%;相反,生长素含量正常花(父本、母本)高于不育花(子代),是不育花的1.17倍和1.89倍。推测可能是不育花中的色氨酸不能转化成生长素而影响花的发育;五是对204 199 条茶树花转录组Unigenes进行SSR简单重复序列的查找,得到含有SSR的序列60 581个,出现频率为29.67%。采用荧光标记PCR技术对设计合成的100对SSR引物进行引物筛选,其中有28对引物扩增条带清晰、多态性好,在4个品种的茶树花中得到有效性验证。通过项目实施发表科技论文6篇(含录用),2名科技人员晋升研究员。

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

DeoR家族转录因子PsrB调控黏质沙雷氏菌合成灵菌红素

DeoR家族转录因子PsrB调控黏质沙雷氏菌合成灵菌红素

DOI:10.3969/j.issn.1673-1689.2021.10.004
发表时间:2021
2

温和条件下柱前标记-高效液相色谱-质谱法测定枸杞多糖中单糖组成

温和条件下柱前标记-高效液相色谱-质谱法测定枸杞多糖中单糖组成

DOI:10.3724/ SP.J.1123.2019.04013
发表时间:2019
3

转录组与代谢联合解析红花槭叶片中青素苷变化机制

转录组与代谢联合解析红花槭叶片中青素苷变化机制

DOI:
发表时间:
4

钢筋混凝土带翼缘剪力墙破坏机理研究

钢筋混凝土带翼缘剪力墙破坏机理研究

DOI:10.15986/j.1006-7930.2017.06.014
发表时间:2017
5

桂林岩溶石山青冈群落植物功能性状的种间和种内变异研究

桂林岩溶石山青冈群落植物功能性状的种间和种内变异研究

DOI:10.5846/stxb202009292521
发表时间:2021

梁名志的其他基金

批准号:31660224
批准年份:2016
资助金额:39.00
项目类别:地区科学基金项目

相似国自然基金

1

茶树抗寒基因分子标记及其机理研究

批准号:30800884
批准年份:2008
负责人:房婉萍
学科分类:C1611
资助金额:18.00
项目类别:青年科学基金项目
2

玉米籽粒高直链淀粉形成的分子机理和功能基因特异标记的开发与利用

批准号:31071424
批准年份:2010
负责人:陈化榜
学科分类:C1307
资助金额:32.00
项目类别:面上项目
3

小麦淀粉合成关键酶基因克隆及特异分子标记的开发与验证

批准号:31260357
批准年份:2012
负责人:李卫华
学科分类:C1307
资助金额:42.00
项目类别:地区科学基金项目
4

茶树咖啡碱合成相关基因的关联分析及功能标记开发

批准号:30901159
批准年份:2009
负责人:金基强
学科分类:C1610
资助金额:19.00
项目类别:青年科学基金项目