lncRNA在类风湿性关节炎中的调控网络及分子功能机制

Rheumatoid arthritis (RA), a chronic systemic autoimmune disease, is a serious health problem. A number of genetic and environmental factors have been involved in the etiology of RA, but the pathogenesis and precise mechanism of RA remain unknown. Long non-coding RNA (lncRNA) is a newly discovered epigenetic regulatory factor, and plays an important role in the immune system. However, the effect of lncRNA on the pathogenesis of RA has not been identified. This project will use the advanced lncRNA/mRNA microarray to systematically test the lncRNA expression profile in peripheral blood mononuclear cells, and establish the lncRNA associated networks and lncRNA-mRNA regulatory networks. We will also perform several experiments, e.g., FISH, over-expression of lncRNA, and siRNA silence, to determine the molecular functions and mechanisms of the identified lncRNA. This project will systemically identify the RA-associated lncRNAs and their functions. The results will provide essential data for discovering novel RA biomarkers and therapeutic targets.

类风湿性关节炎（rheumatoid arthritis，RA）是一种慢性全身性自身免疫病，严重危害人类健康和生命。RA由环境因素和遗传因素共同作用所导致，其病因和发病机制尚未明确。长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）是新近发现的一类非常重要的表观遗传调控因子，在自身免疫系统中起重要调控作用，但在RA致病中的作用未知。本项目拟利用先进的lncRNA/mRNA表达芯片在外周血单个核细胞中系统研究lncRNA的差异表达谱，构建RA的lncRNA关联网络和lncRNA-mRNA调控网路，并通过FISH、lncRNA过表达和siRNA沉默等方法鉴定相关lncRNA的细胞分子功能，为发现新的RA生物标记物和药物治疗靶点提供重要基础数据。

类风湿性关节炎（rheumatoid arthritis，RA）是一种慢性全身性自身免疫病，严重危害人类健康和生命。RA由环境因素和遗传因素共同作用所导致，其病因和发病机制尚未明确。长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）是新近发现的一类非常重要的表观遗传调控因子，在自身免疫系统中起重要调控作用，但在RA致病中的作用未知。本项目利用lncRNA/mRNA表达芯片在外周血单个核细胞中系统研究lncRNA的差异表达谱，构建RA的lncRNA关联网络和lncRNA-mRNA调控网路，并通过lncRNA过表达和siRNA沉默等方法鉴定相关lncRNA的细胞分子功能。本项目病例对照样本间表达水平差异倍数大于等于2且p值小于2×10-6（Bonferroni校正）的lncRNA有 44个。整合因果推断检验（CIT）、eQTL和WGCNA检测lncRNA-mRNA调控网络和交互作用模块。使用RT-PCR方法，我们验证了5个差异表达的lncRNA。功能试验表明敲低lncRNA-Z93241.1促进293T细胞的增殖，过表达lncRNA-Z93241.1可以抑制Jurkat T细胞增殖。本项目表明lncRNA在RA的发生发展中的重要作用，为发现新的RA生物标记物和药物治疗靶点提供重要基础数据。