甘薯块根膨大发育转录组研究

甘薯块根膨大发育是干物质积累的过程，是决定甘薯产量的基础。明确块根膨大发育机理，促进不定根向块根的转化，减少牛蒡根的形成，对提高甘薯产量具有重要的意义。但块根膨大发育是一个多基因控制的复杂过程，仅从单个基因很难阐明其机制。因此，本项目在前期采用高通量Solexa测序技术对甘薯块根和牛蒡根几个关键发育时期进行转录组测序，并获得块根膨大发育的基因序列和转录组信息的基础上，整合GenBank中甘薯基因序列，研制高密度甘薯基因芯片研究块根和牛蒡根不同发育时期的基因表达谱，筛选块根膨大相关候选基因，并对候选基因进行时空表达模式分析。通过整合高通量测序获得的块根膨大转录组特征，基因芯片建立的表达谱以及候选基因的表达信息，从转录水平和个体水平初步解析甘薯块根膨大发育的基因表达调控机理，为深入阐明甘薯块根膨大发育分子机理搭建平台，同时也为将来甘薯高产品种的选育奠定理论基础。

甘薯块根膨大发育是干物质积累的过程，是决定甘薯产量的基础。明确块根膨大发育机理，促进不定根向块根的转化，减少牛蒡根的形成，对提高甘薯产量具有重要的意义。但块根膨大发育是一个多基因控制的复杂过程，仅从单个基因很难阐明其机制。因此，本项目在前期采用高通量Solexa 测序技术对甘薯块根和牛蒡根几个关键发育时期进行转录组测序，并获得块根膨大发育的基因序列和转录组信息的基础上，整合了GenBank 中甘薯基因序列，研制了包含39,724个甘薯基因的高密度基因芯片，并利用该芯片研究了甘薯块根和牛蒡根不同发育时期的基因表达谱，筛选到了块根膨大相关候选转录因子IbBEL，并对IbBEL基因家族成员进行了时空表达模式和激素诱导表达模式分析。从转录水平和个体水平初步解析甘薯块根膨大发育的基因表达调控机理，为深入阐明甘薯块根膨大发育分子机理搭建平台。