蛋白质折叠信息数据库及折叠经验规律探索

蛋白质折叠规律的研究是生命科学重大前沿课题。本课题拟构建蛋白质折叠类型数据库，研究蛋白质折叠的经验规律。研究内容包括：1、蛋白质折叠类型信息数据库的建立，定义规范折叠分类的量化指标。从PDB、SCOP等数据库出发，在已有研究工作基础上完成上述内容。2、蛋白质折叠类型与物种、蛋白质功能、亚细胞定位等信息的相关性研究。3、蛋白质折叠类型与氨基酸序列关系研究，探索蛋白质折叠的经验规律。通过序列比对和统计分析相结合的方法，分析蛋白质折叠的氨基酸序列特征，寻找经验规律，探索折叠类型形成的物理基础。4、构建蛋白质折叠类型演化树图。结合蛋白质折叠类型的空间结构特征及其序列模式，综合利用聚类等统计学方法，给出不同折叠类型蛋白质序列的进化与折叠类型演化之间的关系。研究结果对蛋白质设计和折叠动力学实验具有指导作用，并为精确的蛋白质三级结构预测、蛋白质结构与功能的关系打下基础。