藏鸡高海拔低氧适应相关基因表达与网络分析

藏鸡是我国青藏高原特有的原始小型地方鸡种，对高海拔低氧环境具有稳定遗传的适应能力。本研究选择包括低氧诱导转录因子、细胞与生长因子以及神经递质生物合成、氧结合蛋白、血管舒张因子、葡萄糖代谢等途径中关键酶等32个基因作为低氧适应相关候选基因。设计探针，制备含多基因点阵的芯片，利用芯片杂交、扫描和数据标准化研究这些基因在藏鸡（以低地鸡作对照）模拟低氧孵化和常氧孵化时不同胚胎发育阶段心脏、肝脏、尿囊绒毛膜和肺脏等组织中定量表达；Bayesian Network法分析低氧适应性多基因调控网络，解析多因子之间的相互关系，分析藏鸡与低地鸡在低氧环境中胚胎发育启动和改变转录活性的基因，找到这些基因中对胚胎低氧适应调控起主导作用的一两个基因；然后进一步测定此关键基因的mRNA和蛋白表达，筛选SNP标记；揭示这些基因以及整个网络在藏鸡低氧适应中的功能，从系统生物学角度解析低氧适应的分子机制。