基于网络核与核度理论的基因网络研究

如何从海量的数据中准确有效地获得基因间相互作用的信息，构建合适的形式化模型，研究分析基因组数据间的关系并从中发现生物学规律，是人类基因组计划所面临的新挑战。目前主要从加权矩阵、Boole代数、相关系数、线性组合、共享信息关联网络等角度研究基因网络。我们在近几年的研究中发现，图论，特别是图论中的核与核度理论在研究基因网络时具有"天然"的优势。故本课题拟利用图论中网络的核与核度理论，分析基因调控网络中决定生物性状的关键基因组，建立基因网络的主基因分析理论及方法。在此基础上，深入研究网络的稳定性、动态性、可达性及可约简性等行为和状态特征；研究基因调控网络的可信性指标及评价方法；建立生物性状生命周期的基因调控网络仿真模型，开发基因网络可信性评价体系的计算机分析系统。本项目将为分析基因如何决定生物性状表现提供理论及形式描述方法，并为进一步预测基因的未来表达提供分析手段。