弱精症、精子畸形症及正常男性精子的多种RNA表达谱的构建与分析

基本信息
批准号:81200464
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:23.00
负责人:谢兰
学科分类:
依托单位:清华大学
批准年份:2012
结题年份:2015
起止时间:2013-01-01 - 2015-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:郭永,严杰,徐友春,吴婧娇,李卓琦,丘天
关键词:
基因表达谱长链非编码RNA微小RNA弱精症精子畸形症
结项摘要

Asthenozoospermia and teratozoospermia are both major causes of infertility or reduced fertility in men, while the etiology and pathogenic mechanisms of the two diseases remain to be explored. The presence of different RNA populations in human ejaculate spermatozoa is well established, yet little is known of the functional significance of these transcripts. This project aims to combine a variety of independently-developed high-throughput biochip platforms, to construct and analyze the mRNA profiles, miRNA profiles and long non-coding RNA profiles of spermatozoa from normal fertile men, asthenozoospermic patients and teratozoospermic patients. Also, we hope to characterize the differentially expressed mRNAs, miRNAs and lncRNAs in the sperm cells of asthenozoospermic or teratozoospermic patients compared with control fertile men. Through the following bioinformatics analysis, we anticipate the construction of a regulatory network of different RNA populations and the discovery of some novel critical target molecules. Realtime PCR validation will be performed for the key target molecules. Establishing the mRNA profiles of sperm from two different infertility-related diseases and normal fertile men, will reveal the significant events occuring during spermatogenesis. The establishment of the miRNA expression profiles and lncRNA profiles of sperm will characterize the miRNA and lncRNA abundance in aforementioned status for the first time, which provides possibility to investigate the implication of these molecules in the pathogenic mechanisms in asthenozoospermia or teratozoospermia and to consider their potential utility as biomarkers for the infertility diagnosis or prognosis in the future.

弱精症和精子畸形症是临床上常见的男性不育疾病,而目前人们对于两种疾病的病因及发生机理还缺乏全面而系统的认识。成熟精子中存在着少量的各种形式的RNA,然而对这些转录子的功能却有待深入挖掘和阐明。本课题旨在利用实验室自主研发的多种高通量生物芯片平台,全面构建正常男性、弱精症、精子畸形症患者的精子的mRNA、miRNA、长链非编码RNA表达谱并找到在弱精症、精子畸形症患者的精子中异常表达的mRNA、miRNA、长链非编码RNA。在此基础上,通过生物信息学的方法深入挖掘多种RNA的调控关系网络并寻找可能有重要意义的节点,并对关键性的靶分子进行realtimePCR验证。通过全面建立两种不同疾病及健康状态下精子mRNA、miRNA、长链非编码RNA表达谱,可以进一步揭示精子发生过程中的异常事件和致病机理,丰富对于精子中非编码RNA的表达情况和功能的认识,也可能为未来的男性不育诊断提供新的生物标志物。

项目摘要

弱精症和精子畸形症是临床上常见的男性不育疾病,而目前人们对于两种疾病的病因及发生机理还缺乏全面而系统的认识。成熟精子中存在着少量的各种形式的RNA,然而对这些转录子的功能却有待深入挖掘和阐明。本研究利用实验室自主研发的多种高通量生物芯片平台,全面地构建了正常男性、弱精症、精子畸形症患者的精子的mRNA、miRNA、长链非编码RNA 表达谱并找到了一系列在弱精症、精子畸形症患者的精子中异常表达的mRNA、miRNA、长链非编码RNA。在此基础上,通过生物信息学的方法深入挖掘了多种RNA 的调控关系网络。利用协方差分析方法找到37个探针,可有效区分弱精症患者、精子畸形症患者、正常男性志愿者的精子,利用这37个探针作为特征变量,部分样品作为训练集,分别利用PAM方法和SVM方法对剩余样品进行预测,预测结果显示准确率可达80%以上。在独立样本中,对37个关键性的靶分子进行了realtimePCR 验证,证实了这些分子很有潜力作为弱精症和精子畸形症的分子标志物。通过全面建立两种不同疾病及健康状态下精子mRNA、miRNA、长链非编码RNA 表达谱,可以进一步揭示精子发生过程中的异常事件和致病机理,丰富对于精子中各种RNA 的表达情况和功能的认识,也为未来的男性不育诊断提供新的生物标志物。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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