蛋白质远程同源检测中的核方法研究

基本信息
批准号:30570368
项目类别:面上项目
资助金额:20.00
负责人:黄德双
学科分类:
依托单位:中国科学院合肥物质科学研究院
批准年份:2005
结题年份:2008
起止时间:2006-01-01 - 2008-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:谭明亮,周耀旗,赵兴明,王兵,陈鹏,贾伟,李晶晶,张静茹,夏俊峰
关键词:
特征抽取蛋白质远程同源检测隐马尔科夫核方法支持向量机
结项摘要

本项目利用蛋白质的同源性,将未知蛋白质归类到已知结构和功能特征的蛋白质家族中去,并利用已知蛋白质家族的结构和功能来预测未知蛋白质的结构和功能。与传统的应用到生物信息学中的机器学习算法不同,本项目除了考虑蛋白质的序列之间的关系外,也将蛋白质之间的结构关系考虑进来。这对于远程同源检测(序列之间的相似性程度<=30%)非常有帮助,因为蛋白质的结构与序列相比具有更好的保守性。本项目将利用蛋白质之间的结构关

项目摘要

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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