果蝇微小RNA调控机制中一些问题的研究

微小RNA是一类重要的调控因子，它的发现改变了生命科学中心法则中对RNA的认识。在多细胞动物中，微小RNA通过碱基互补特异地结合靶基因3'-UTR区元件，抑制靶基因的翻译或导致其降解。微小RNA具体调控谁，以及由谁来控制微小RNA是本领域研究中迫切需要解决的问题。换言之，以构建微小RNA为核心的调控网络为切入点，揭示上游转录调控元件、微小RNA和下游被调控的靶标mRNA在基因调控网络中的关系将使我们在转录和转录后调控两个层次间建立一座认识的桥梁。本项目利用模式生物果蝇作为研究材料，利用机器学习和模式识别的方法，对果蝇12个亚种的基因组进行比较，发掘在进化上保守的调控微小RNA的转录因子结合位点以及微小RNA与靶基因的结合位点。进而利用统计学方法建立调控元件与微小RNA及微小RNA与其靶标基因的表达信息之间的联系，构建微小RNA的调控网络，并实现调控元件数据库在线浏览。