分子对接新方法及蛋白质-蛋白质相互作用原理的研究

随着人类基因组计划的完成和后基因组时代的开始，海量的蛋白质数据使得各种计算机分析方法在生物学研究中起着越来越大的作用。分子对接正是其中对蛋白质相互作用过程进行计算机模拟的一类方法，发展可靠准确的分子对接方法已经逐渐成为目前国际上研究的热点。2001年，国际上组织了第一次复合物结构预测评估（CAPRI）。我们参加了2005-06年的评估。本课题所发展的软件包SOFTDOCK是最早提出的分子对接方法之一，经过多年的努力已比较成熟，测试得到的结果已不亚于其他公开软件包。因为我们已经得到UCBerkeley对SOFTDOCK版权的认可（正式函），我们将公开发行SOFTDOCK的学术版本并进行更为全面和系统的数据测试和程序优化，同时发展出新的对接方法以完善SOFTDOCK的功能，并将继续参加下一次的国际复合物结构预测评估。