胰岛素抵抗相关基因罕见遗传变异与多囊卵巢综合征的关联研究

基本信息
批准号:81501231
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:18.00
负责人:李淑元
学科分类:
依托单位:上海交通大学
批准年份:2015
结题年份:2018
起止时间:2016-01-01 - 2018-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:谈雅静,张军玉,丁国莲,陈松长,吴丹丹,张颖
关键词:
罕见变异新一代测序胰岛素抵抗多囊卵巢综合征
结项摘要

Polycystic ovary syndrome (PCOS) is the most common endocrine disease in women of reproductive age. In addition to its reproductive features, such as reduced fertility, PCOS also has numerous metabolic consequences, including increased risk of type 2 diabetes mellitus and cardiovascular disease. Although PCOS is a complex disease with a heritability of approximately 70%, most genetic variants identified so far confer relatively small increments in risk, leading to missing heritability. We suppose that the major causes of missing heritability of PCOS are caused by rare variants, which are not tested systematically in previous studies. To test this hypothesis, deep resequencing of functional regions of about 200 genes in the insulin resistance pathway, about 800 kb per individual, will be conducted in 150 PCOS cases and 150 healthy controls to screen the full set of variants systematically using next-generation sequencing platform with the coverage of 100×. Further study combined with bioinformatics methods will be used to explore the association of the rare variants in the target genes with PCOS, endocrine and metabolic phenotype, and clarify the role of rare variants in the pathogenesis of PCOS. Our study will provide insights into the pathogenesis of PCOS and the development of new drug targets.

多囊卵巢综合征(PCOS)是育龄妇女常见的生殖内分泌系统疾病,不但导致不孕,而且相应个体罹患糖尿病和心血管疾病的风险亦增加。PCOS是高度遗传的复杂疾病(遗传贡献约70%),虽经多年研究,但所发现的遗传易感位点远不足以解释其遗传度,存在遗传度丢失。我们推测之前研究策略未能系统检测的罕见变异是造成PCOS遗传度丢失的主要原因之一。为验证这一假设,我们拟选择PCOS病理生理机制中的关键环节——“胰岛素抵抗”的相关基因(约200个),依托新一代测序平台,在150例PCOS病例及150例对照中对这些基因的功能区段进行深度测序(总长度约800kb/个体,拟测序深度100×),并结合生物信息学手段,探索目标区段内同PCOS相关的功能性罕见变异,并分析罕见变异同PCOS生殖内分泌、代谢表型的关联,以期阐明罕见变异在PCOS发病中的作用,为今后深入研究PCOS的发病机理以及药物靶点的开发提供依据及思路。

项目摘要

囊卵巢综合征(PCOS)是育龄期妇女常见的生殖内分泌系统疾病,给个人、家庭及社会均带来沉重的负担。既往研究表明,PCOS是高度遗传的复杂疾病,遗传在其中的贡献约占到70%,然而,虽经多年研究,目前所发现的遗传易感位点远不足以解释其高的遗传度,存在遗传度的丢失,我们推测,既往研究策略未能系统检测到的罕见变异可能是造成PCOS遗传度丢失的主要原因之一。为验证这一假设,我们依托新一代测序平台,对基因组中的外显子区域进行了深度测序,结合生物信息学手段,系统阐释了PCOS病例及对照中基因中各类型遗传变异的分布。发现包括chr19:54744363、rs368202391、rs782772111、rs748678217、rs201612562、rs757300194、rs17844457等多个罕见变异位点、以及PRSS1、SVIL、TAL1、KRT6C、GSN、ZNF705D、DIAPH1、CARD17、ZCRB1等多个基因的罕见变异在PCOS病例中富集,提示这些位点及基因在PCOS发生中发挥作用。此外,我们也发现了一些同PCOS及相关生殖内分泌指标相关的常见变异。通过上述研究,本课题组发现了一批同PCOS发生相关的基因以及遗传变异位点,细化了遗传变异同PCOS表型的相关联系,验证了本课题的研究假设,为进一步探索PCOS与遗传变异之间的规律、以及新的治疗及药物靶点的开发提供了线索和基础。在本基金资助下,已发表SCI论文3篇,国内核心期刊论文1篇。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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