牙鲆转录组中鳗弧菌抗性相关的SNP筛查及关联分析

牙鲆是我国黄、渤海重要的经济鱼类，随着牙鲆养殖业，特别是高密度集约化养殖的蓬勃发展，牙鲆细菌性疾病日趋严重，成为制约养殖发展的重大障碍，因此改善其抗病相关性状是其遗传改良的重要目标。而筛选与牙鲆抗细菌性疾病相关的分子标记，用于辅助选择抗病牙鲆群体、家系，是牙鲆抗病育种的重要并可靠的途径。本项目拟利用选择育种中筛选分析候选基因的"候选基因生物信息学分析"，系统分析我们已获得的牙鲆转录组测序ESTs，筛查与牙鲆与免疫和抗性相关的基因内部的SNP位点，并利用高分辨率熔解曲线技术，在所构建的牙鲆家系中，寻找对鳗弧菌病抗性有显著差异的家系，以此为材料进行SNP基因分型。筛选出敏感家系、抗性家系间以及敏感家系内死亡个体和成活个体间存在显著差异的SNP分子标记；并利用这些标记的基因型对于牙鲆鳗弧菌病的易感/抗性性状进行关联分析。确定获得的与牙鲆鳗弧菌病易感/抗病相关联的SNP分子标记。

筛选与牙鲆抗细菌性疾病相关的分子标记，用于辅助选择抗病牙鲆群体、家系，是牙鲆抗病育种的重要并可靠的途径。本课题以牙鲆为主要研究对象，进行了牙鲆实验用家系的构建工作，利用这些牙鲆家系进行了鳗弧菌感染实验，筛选出了针对鳗弧菌的牙鲆敏感家系和抗性家系；开展了牙鲆免疫、抗病相关基因的克隆与表达分析，获得了抗性相关的多个基因；利用生物信息学的手段，在牙鲆抗性相关的基因中筛查到200余个SNP位点，利用高分辨率熔解曲线分析和重测序技术进行了SNP位点与敏感、抗病性状的关联分析，获得了牙鲆鳗弧菌感染前后具有显著差异的多个SNP位点；构建了牙鲆高密度遗传连锁图谱，进行了牙鲆抗病相关SNP位点在图谱的初步定位。本课题的结果为牙鲆抗病育种辅助选择提供了工具，进一步提高牙鲆抗病育种效率。