转录因子E4BP4在小鼠肝再生早期的生物学功能及作用机制

Gene expression and regulation has always been a hot issue in the research of liver regeneration (LR). Due to the limitation in technology, there is a lack of systemic exploration of transcription factors that are involved in LR. In our previous study, we have identified that the activity of E4BP4 was strongly up-regulated during the early phase of LR via a TF-array analysis. Therefore，in the present investigation, we aim to elucidate the role and mechanism of E4BP4 during LR by using a lentivirus-mediated RNAi system, ChIP-seq technology, co-immunoprecipitation and mass spectrometry, and so on. We also aim to discover its possible down-stream taget genes including mRNA and non-coding RNA. This investigation will be helpful in exploring the function of E4BP4 and its related signaling pathways, thus providing fundamental basis for the treatment of liver damage and repair post-surgery.

基因表达和调控一直是肝再生领域的研究热点和难点。由于技术手段限制，目前仍缺乏对转录因子参与肝再生早期转录调控的系统挖掘和深入研究。本课题组前期工作通过转录因子活性谱芯片筛选技术首次发现，在小鼠肝再生启动阶段，转录因子E4BP4活性显著升高。另有文献报道，E4BP4参与了细胞增殖、凋亡以及分化等生理过程。此外，它还与肝脏代谢功能有关。因此，本项目拟对E4BP4在肝再生早期的作用和机制进行全面阐述。我们拟通过基因敲减、染色质免疫共沉淀结合测序（ChIP-seq）、免疫共沉淀结合质谱等策略系统地探索E4BP4的生物学功能和信号转导机制，并同时从mRNA和非编码RNA角度探讨其下游靶基因。本课题不仅丰富了关于肝再生早期基因转录调控机制的研究，更为肝损伤防治和术后再生修复提供坚实的理论依据。

基因表达和调控一直是肝再生领域的研究热点和难点。由于技术手段限制，目前仍缺乏对转录因子参与肝再生早期转录调控的系统挖掘和深入研究。本课题组通过转录因子活性谱芯片筛选技术发现，在小鼠肝再生启动阶段，转录因子E4BP4、USF1活性显著升高，HNF4A活性明显降低。首先，我们观察到肝再生早期升高的E4BP4主要定位于NK细胞，且E4BP4敲除并不影响肝再生的进程。其次，我们联合运用ChIP-on-chip和mRNA芯片技术构建了多个转录因子及其靶基因的调控网络，进一步揭示了肝再生早期的基因表达和调控规律。本课题不仅丰富了关于肝再生早期基因转录调控机制的研究，更为肝损伤防治和术后再生修复提供坚实的理论依据。