调控细胞因子的miRNA结合靶点区SNPs与藏族人群结核病易感性及功能分析

基本信息
批准号:30960347
项目类别:地区科学基金项目
资助金额:25.00
负责人:扎多
学科分类:
依托单位:西藏自治区人民医院
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:黄丽萍,美朗曲措,何超,彭浩,边玛措,普布卓嘎,宋兴勃,卢振产,潘晓夫
关键词:
结核病藏族miRNASNPs
结项摘要

研究表明,细胞因子是结核感染过程中关键的效应因子,miRNA 靶基因3′UTR 内存在的单核苷酸多态性(SNPs)影响miRNA的作用,参与调控宿主感染免疫。前期我们发现白介素-10(-592A/C)是藏族结核的易感基因,在此基础上我们推测:细胞因子miRNA 靶基因3′UTR 内存在的SNPs影响miRNA的作用,调控宿主对结核感染免疫。本课题拟采用生物信息学、遗传学、统计学、分子生物学等方法,筛查藏族人群结核易感相关的细胞因子miRNAs结合靶点内的SNPs,对不同程度结核病的藏族患者与对照人群进行基因分型,筛选存在显著性差异的SNPs,进行遗传不平衡检验,通过荧光素酶重组载体法,结合生物信息学方法进行确证及功能分析,研究miRNAs和SNPs对目标基因表达影响,鉴定候选SNPs 在藏族结核病人发生发展中的作用机制,为最终阐明遗传变异在藏族结核病人中的分子作用机制奠定理论基础。

项目摘要

本课题采用了生物信息学、遗传学、统计学、分子生物学等方法,筛查藏族人群结核易感相关的细胞因子miRNAs结合靶点内的SNPs,对不同程度结核病的藏族患者对照人群进行基因分型,筛选存在显著性差异的SNPs,进行遗传不平衡检验,结合生物信息学方法进行确证及功能分析,研究miRNA和SNPs对目标基因表达影响,鉴定候选SNPs在藏族结核病发生发展中的作用机制,项目按照计划书如期完成相关研究工作,结果表明: 调控IL-1R1的miRNA及参与miRNA成熟通路的相关基因是藏族结核病的易感基因之一, 调控炎性细胞因子IL-1R1的miRNA及其成熟通路的相关基因内SNPs与西藏藏族结核病严重程度及传染性相关。本研究系首次报道调控炎性细胞因子IL-1R1的miRNA靶基因多态性与西藏地区藏族结核病易感相关性,具有重要意义。本研究初步探讨了参与miRNA成熟通路的相关基因与藏族结核病易感相关性,发现了具有差异性的SNPs,进一步的功能分析研究将对阐明西藏地区结核病的发病与严重程度等与miRNA成熟通路的相关基因SNPs具有重要意义。项目相关成果,发表了一篇SCI收录论文及一篇中文核心期刊论文,参加国内学术会议一次。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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