非小细胞肺癌预后相关微小RNA多态的筛选与功能研究

肺癌是目前全球受累人数最多的恶性肿瘤，即使临床分期相同的个体接受同样的治疗方案，治疗效果和生存时间往往差异很大，如何选择稳定的生物标志物预测病人的化疗敏感性和预后，并据此进行个体化治疗，以提高患者的生存质量，延长生存时间，是目前国内外研究的热点。申请者前期的研究显示，微小RNA（miRNA）上的功能性SNP可以作为生物标志物预测非小细胞肺癌（NSCLC）的预后，本研究将在此基础上，筛选miRNA转录调控区, pre-miRNA区域和miRNA目标mRNA结合区与NSCLC预后可能相关的功能性SNPs，运用已建立的大样本NSCLC临床队列，通过两阶段设计探讨多个miRNA相关SNPs单独或联合与NSCLC预后的关系，综合评价基因型-表型相互关系，并进行相关SNP、miRNA的功能研究，阐述其影响NSCLC治疗效果和预后的机制，为NSCLC个体化治疗和预后判断提供依据。

本项目基于大样本的非小细胞肺癌（NSCLC）临床队列，应用Illumina Golden Gate等基因分型平台系统分析了各类型miRNA相关SNPs与NSCLC预后和化疗敏感性关系，建立中国人群NSCLC重要miRNA相关SNPs及其表型变异的生物信息库，阐明基因型-表型的相互关系；通过独立NSCLC样本中进行了验证，发现了pre-miRNA侧翼区（rs928508）和RAD52基因3’-UTR的hsa-let-7结合区域多态性（rs7963551）与NSCLC预后显著有关，应用miRNA相关多态的基因型构建了NSCLC预后的遗传预测模型，其可显著改善传统因素（如肿瘤分期）对NSCLC预后的预测能力；对NSCLC预后相关的SNPs进行生物功能学研究发现，rs928508多态性可能参与从Pri-miR-30c向Pre-miR-30c的转化过程，影响miR-30c的成熟与表达，而rs7963551-C等位基因显著削弱let-7与RAD52基因3’-UTR的结合能力，导致RAD52的表达水平上调，初步阐明了miRNA相关SNPs参与NSCLC预后的功能学含义；在项目实施研究过程中，项目组密切关注国内外相关领域的研究进展，进一步分析了多个miRNA调控通路（如DNA修复通路、代谢通路等）的基因SNPs与肺癌预后的关联，发现了多个SNPs可单独或联合影响肺癌的预后；此外应用全基因组关联研究策略，探讨了晚期非手术NSCLC患者预后以及铂类化疗毒副反应（骨髓抑制和肝脏毒性）的全基因组关联分析，发现3p22.1、5p14.1、14q24.3、7q31.31和 9p21.3五个区域遗传变异与NSCLC预后相关，14q21.3和12q13.13两个区域遗传变异与骨髓抑制毒性相关，21q22.3区域遗传变异与肝脏毒性相关。本项目的顺利实施初步阐明了miRNA相关遗传变异影响NSCLC预后的潜在遗传机制，为NSCLC个体化治疗和预后判断提供依据。