基因芯片用于中药作用机制研究的数据重现性问题分析

作为系统生物学的重要研究手段之一，基因芯片已被大量用于中药作用机制研究等领域。但芯片数据的重复性、再现性及不同平台结果的可比性等具体技术问题仍然存在争议，制约了基因芯片技术在中医药学研究中的进一步推广。.本申请选择黄芪丹参方治疗大鼠急性心肌梗塞机制研究为具体模式对象，用Affymetrix、Agilent和Illumina等三个最常用的芯片分析平台，分别考察给药组、模型组和假手术组芯片数据的平台内重复性、再现性以及不同平台结果的可比性，并回溯分析各实验操作和数据分析环节对结果的影响，以期为基因芯片技术用于中药作用机制研究提供实际指导。本项目的实施结果（不论是正面还是反面）将是对生物芯片质量控制（MAQC）国际合作计划的重要补充，有助于完善芯片技术，拓展和丰富中医药研究手段，从而推动和加快中药作用机制等相关研究进程。