离子诱导DNA构象转变的密度泛函理论研究

基本信息
批准号:20876083
项目类别:面上项目
资助金额:32.00
负责人:于养信
学科分类:
依托单位:清华大学
批准年份:2008
结题年份:2011
起止时间:2009-01-01 - 2011-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:李英峰,彭勃,黄军其,展侠,公强
关键词:
电解质溶液DNA构象转变解聚密度泛函理论
结项摘要

DNA纳米器件工作原理是基于离子诱导DNA的B-Z构象转变,研究各种离子诱导的DNA构象转变对于生物化学、生物化工分离DNA产品的工艺设计以及DNA纳米器件等新技术的开发都有着重要的科学价值和理论意义。本研究以申请人提出的混合电解质溶液的密度泛函理论为基础,结合不同构象的DNA模型,提出能预测DNA各种构象在电解质溶液中的自由能变化的新方法,并用全原子分子动力学模拟数据加以检验。然后根据实验数据确定DNA各种构象的模型参数,将所建立的理论方法应用于研究DNA在电解质溶液中的B-Z构象转变以及三螺旋DNA或双螺旋DNA的解聚构象转变,并预测出离子诱导DNA构象转变的相图,获得DNA各种构象稳定的溶液条件,填补国内在离子诱导DNA构象转变理论研究方面的空白,为生物化工分离制备DNA产品的工艺设计以及DNA纳米器件等新技术的开发提供理论基础。

项目摘要

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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