新疆维吾尔、哈萨克、汉族结核病相关易感基因多态性及表达质谱的绘制

基本信息
批准号:81160001
项目类别:地区科学基金项目
资助金额:54.00
负责人:吴江东
学科分类:
依托单位:石河子大学
批准年份:2011
结题年份:2015
起止时间:2012-01-01 - 2015-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:沈建军,赵咏梅,刘钢,卢慧,赵明,尹来波
关键词:
结核病(TB)基因表达谱易感基因基因芯片
结项摘要

利用基因芯片技术检测新疆地区维吾尔族、哈萨克族、汉族外周血HLA-DR,HLA-DQ,MBL基因表达谱的变化,通过病例对照研究的方法,运用分子生物学技术,全面系统的比较分析和研究易感基因与新疆维吾尔、哈萨克、和汉族人群结核病发生发展的关联。通过观察不同民族基因表达质谱的差异,探讨新疆少数民族结核病(TB)易感基因在TB发生、发展、病理改变及抗痨治疗中的作用,为建立相关基因表达数据库和绘制TB相关基因作用通路式网图,进一步寻找各种病理条件下结核病基因标志物提供资料,并为探讨在TB发生、发展中关键作用的基因特异性治疗提供依据。

项目摘要

背景:.(1)探讨新疆汉族、哈族、维吾尔族结核病相关易感基因(2)寻找新等位基因。.内容:.(1)采用病例—对照分析法,应用以DNA测序为基础的基因分型方法(PCR-SBT)对我国新疆石河子汉族92例肺结核患者和96例健康对照者分别进行HLA-DRB1和DQB1及DPB1位点的等位基因高分辨率分型。(2)采用同样方法,对新疆沙湾哈萨克族45例肺结核病例者和90例新疆哈萨克健康对照者分别进行HLA-DRB1和DQB1及DPB1位点的等位基因分型,统计采用X2检验、P值计算、单倍型计算,研究不同等位基因频率与新疆哈萨克族结核病关联性。(3)对怀疑新基因样本“wp47”,发现新等位基因。(4)使用(imLDR)方法对HLA基因、MBL2基因多态性进行分型。.结果:.(1)汉族中:肺结核组中DRB1*07:01基因频率明显高于对照组;肺结核组中DQB1*03:01基因频率明显高于对照组;肺结核组中DPB1*02:01基因频率明显低对照组,统计学具有显著差异性。单倍型检验中发现DRB1*11:01-DQB1*03:01- DPB1*05:01单倍型频率病例组中显著高于对照组,统计学有差异显著性;DRB1*07:01-DQB1*02:02单倍型频率在病例组中明显高于对照组,统计学差异显著性;DQB1*03:01-DPB1*05:01单倍型在病例组中频率显著高于对照组,具有统计学差异显著性;DQB1*03:03-DPB1*05:01单倍型在病例组频率显著高于对照组,具有统计学差异显著性。.(2)哈萨克人群中:HLA-DRB1基因型频率在病例组与对照组频率分布无明显差异性;而DQB1*03:02在对照组中显著增高,具有统计学差异显著性;而DQB1*05:01在患病组中显著增高具有统计学差异显著性;DPB1*04:01在病例组中频率显著高于对照组,统计学差异显著性;DRB1*03:01-DQB1*02:01-DPB1*04:01 单倍型在病例组中频率显著高于对照组统计学差异显著性。.(3)发现新等位基因HLA-DRB1*16:36。.(4)没有发现HLA-DPA1 rs3077, HLA-DPB1 rs9277535, HLA-DQB2 rs7453920, MBLs1800450, rs7095891 和 rs7096206的多态性有显著差异性。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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