西南地区5种特有动物粪便放线菌多样性研究

放线菌是发现药物先导化合物的重要来源。人类、动物肠道和粪便微生物多样性已经做过一些研究，存在一些可培养、大部分未培养的微生物。但这些工作大多是从致病菌，营养，消化，免疫角度进行的，也有筛选纤维分解菌的工作. 但专门把动物粪便放线菌作为一类资源进行的工作很少. 我们初步研究了竹鼠等4种动物粪便的放线菌, 结果表明: 各种动物粪便存在丰富的放线菌多样性，甚至有新属的存在；其生物活性也多种多样；可能是一类有开发价值的微生物资源。在本室近40年工作的基础上，以新方法，新菌种，新产物，新用途为指导，以西南地区丰富的生物多样性（动物种类占全国之半以上）为依托，本课题选择5种特有动物，设计新分离方法，分离纯培养放线菌，研究其培养条件和生物活性；采用DGGE，克隆测序等分子生物学程序，研究未培养细菌的多样性；以期开辟动物粪便放线菌资源研究的新领域，为放线菌资源利用提供新菌源和参考资料。

放线菌是发现药物先导化合物的重要来源。人类、动物肠道和粪便微生物多样性已经做过一些研究，存在一些可培养、大部分未培养的微生物。但这些工作大多是从致病菌，营养，消化，免疫角度进行的，也有筛选纤维分解菌的工作. 但专门把动物粪便放线菌作为一类资源进行的工作很少. 我们初步研究了竹鼠等4 种动物粪便的放线菌, 结果表明: 各种动物粪便存在丰富的放线菌多样性，甚至有新属的存在；其生物活性也多种多样；可能是一类有开发价值的微生物资源。在本室近40 年工作的基础上，以新方法，新菌种，新产物，新用途为指导，以西南地区丰富的生物多样性（动物种类占全国之半以上）为依托，本课题选择5 种特有动物，设计新分离方法，分离纯培养放线菌，研究其培养条件和生物活性；采用DGGE，克隆测序等分子生物学程序，研究未培养细菌的多样性；以期开辟动物粪便放线菌资源研究的新领域，为放线菌资源利用提供新菌源和参考资料。利用454测序,从7种动物粪便样品中共获得42 540条原始序列，共鉴定获得116个细菌属，其中放线菌门占总测序量的3.2%－15％。其中，东北虎样本中的放线菌门的细菌含量最高（达15%），并且有大量未知的新类群; 初步建立和优化分离方法和培养基, 从这27种动物粪便共分离到2241个放线菌纯培养菌株，鉴定到35个属的放线菌，链霉菌和红球菌分布广、数量多; 从华南虎粪便发现放线菌新属(肠道放线球菌属Eteractinococcus)一个;活性测试表明，部分菌株具抗菌活性, 抗肿瘤活性, 酶活性，且含有几类抗生素的合成酶基因(包括PKS I，PKS II，NRPS，CYP 和AHBA); 对小鼠进行了2株链霉菌的的毒性试验，均无毒性;利用粪便放线菌分离到的菌株制成的复合菌肥在三七根腐病上有很好的防治效果.