动脉粥样硬化DNA甲基化谱分析及其表遗传学机制研究

基本信息
批准号:30960136
项目类别:地区科学基金项目
资助金额:26.00
负责人:黄玉珊
学科分类:
依托单位:井冈山大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王树人,李爱玉,庄暨军,罗新缘,周青,王霞,张玮,李新华,庄建基
关键词:
多因素降维法甲基化芯片AS相关基因动脉粥样硬化DNA甲基化谱
结项摘要

动脉粥样硬化(AS)已成为全球重要的疾病负担,目前已发现有上百种在AS病变过程中出现表型异常的相关基因,被认为是一类多基因复杂性疾病。现已有大量的研究证实在AS发生发展中存在高频率的基因CpG岛甲基化事件,DNA甲基化异常是AS发生中的普遍现象,并且发现DNA甲基化异常出现在AS病理表现之前,可能是AS 形成的早期标志物。以AS特异性DNA甲基化谱作为表遗传标志在AS的早期诊断与预后评估中具有重要的潜在价值。本项目拟联用甲基化DNA免疫共沉淀与DNA甲基化芯片技术,筛选118个AS相关基因,找出异常甲基化的基因作为AS特异性DNA甲基化谱的候选基因,并在人体和动物两个层面检测候选基因的甲基化状态,并运用多因素降维法综合分析多个基甲基化异常事件的联合作用对AS的影响,找出具有最小预测错误率和最大交叉验证一致性的最优模型,建立预测性较好的DNA甲基化谱,并同步探讨出现甲基化异常的表遗传学机制。

项目摘要

动脉粥样硬化(AS)已成为全球重要的疾病负担,在AS 发生发展中存在高频率的基因CpG 岛甲基化事件,DNA 甲基化异常是AS 发生中的普遍现象,本项目联用甲基化DNA 免疫共沉淀与DNA 甲基化芯片技术,筛选了118 个AS 相关基因,初筛发现22个启动子区存在异常甲基化的基因作为AS 特异性DNA 甲基化谱的候选基因,其中有7个启动子区存在低甲基化的基因,15个基因启动子区出现高甲基化状态。进一步在人体和动物两个层面检测候选基因的甲基化状态,并运用多因素降维法综合分析多个基甲基化异常事件的联合作用对AS 的影响,发现有5个基因的高甲基化事件和2个基因的低甲基化事件在动脉粥样硬化病人中属高频发事件, 该DNA甲基化谱的差异反映了动脉粥样硬化中的表观遗传学改变, 提示该AS 特异性DNA 甲基化谱系可能是AS 形成的表遗传标志,在AS 的早期诊断与预后评估中具有重要的潜在价值。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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