绒山羊次级毛囊周期性发育相关基因的筛选及功能验证

基本信息
批准号:31101684
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:10.00
负责人:耿荣庆
学科分类:
依托单位:西北农林科技大学
批准年份:2011
结题年份:2012
起止时间:2012-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:陈玉林,杨朝霞,白丁平,姜维,袁超,曹春娜
关键词:
周期性发育绒山羊基因次级毛囊
结项摘要

运用基于mRNA solexa测序技术的数字基因表达谱RNA-Seq分析方法,检测陕北白绒山羊生长期、退行期和休止期次级毛囊的基因差异表达,结合生物信息学分析,筛选与绒山羊次级毛囊周期性发育相关的基因;以筛选的显著差异表达基因为靶基因,构建重组腺病毒RNA干扰载体,转染体外分离培养的生长期、退行期和休止期次级毛囊组织,结合实时定量PCR和Western blot技术,在mRNA水平和蛋白水平上检测靶基因对β-catenin、Shh、Notch-1、TGF-β1、BMP2等调控毛囊发育相关基因mRNA表达丰度和蛋白表达量的影响;运用免疫共沉淀法分析靶基因与β-catenin、Shh、Notch-1、TGF-β1、BMP2等基因的作用关系,探索靶基因在次级毛囊周期性发育过程中的调控作用。旨在揭示绒山羊次级毛囊周期性发育的分子调控机理,为实现人工调控绒毛生长、加快绒山羊遗传育种进展提供理论依据。

项目摘要

运用基于mRNA solexa测序技术的数字基因表达谱RNA-Seq分析方法,检测陕北白绒山羊次级毛囊生长期、退行期和休止期的基因差异表达,结合生物信息学方法筛选与绒山羊次级毛囊周期性发育相关的基因。. 研究结果表明:在生长期、退行期和休止期共筛选出1322个差异表达基因,归类为53个功能类群;生长期与退行期、生长期与休止期的基因表达差异都相对较小,退行期与休止期的基因表达差异较大;共有1129个差异表达基因通过KEGG注释到各种生化代谢途径和信号转导途径。通过实时定量PCR检测和免疫组化技术发现,Lhx2基因和MSX2基因对皮肤毛囊周期周期性变化具有一定的调控作用。. 本项目筛选出次级毛囊不同发育时期的差异表达基因,为深入揭示绒山羊次级毛囊周期性发育的分子调控机理奠定了基础,也能够为实现人工调控绒毛生长、加快绒山羊遗传育种进展提供理论依据。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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