一个功能未知lncRNA-uc.40致胚胎心脏发育畸形的机制研究

基本信息
批准号:81470376
项目类别:面上项目
资助金额:73.00
负责人:余章斌
学科分类:
依托单位:南京医科大学
批准年份:2014
结题年份:2018
起止时间:2015-01-01 - 2018-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:潘亚,董小玥,朱春,刘垚秋,郑意,孙小凡,徐晶,黄文青
关键词:
长链非编码RNAuc40机制心脏发育畸形
结项摘要

Uc.40 is a novel long noncoding RNA (lncRNA) of unknown function that is conserved in multiple species (e.g.,human,rat,mouse,zebrafish),and is highly expressed in myocardial tissue of fetuses with heart malformation identified by lncRNA microarray. We previously found that overexpression of uc.40 inhibited cardiac differentiation of P19 cells,and overexpression of uc.40 in zebrafish embryos induced cardiac malformation. Furthermore, bioinformatic analyses and experiments suggested that PBX1 was a putative uc.40 target gene. PBX1 gene showed lower levels in myocardial tissue of fetuses with heart malformation, Pbx1 knock-out mice were reported to display cardiac malformations. These results suggest that uc.40 may induce embryonic heart malformations by regulating PBX1 gene. Based on these data,we propose to analyze the temporal and spatial expression pattern of uc.40 during cardiac differentiation and development, and investigate the function of uc.40 using gene overexpression and gene silencing technology in P19 cells and zebrafish. In addition, we take PBX1 as the clue and analyze the interaction between uc.40 and PBX1,which will explore the molecular mechanism of uc.40-induced cardiac malformations in embryos. The effect and mechanism of uc.40 is clarified in embryonic heart development,which will potentially provide a new target for the prevention and treatment of fetal congenital heart disease.

Uc.40是我们采用芯片发现的、不同物种(人、大鼠、小鼠、斑马鱼)间高度保守、高表达于人发育异常胚胎心脏中、功能未知的一条lncRNA。前期发现:过表达uc.40显著抑制P19细胞向心肌细胞分化;过表达uc.40可致斑马鱼出现心脏畸形表型;软件分析与实验提示PBX1可能为uc.40调控靶标;PBX1低表达于人发育异常胚胎心肌组织中,而文献报道敲除PBX1可致小鼠心脏发育畸形,提示uc.40可能通过调节PBX1致胚胎心脏发育异常。研究拟分析uc.40在心脏发育中的时空表达规律;以基因过表达/沉默技术,在P19细胞、斑马鱼中探讨uc.40对心肌细胞功能和心脏发育的影响;以PBX1为线索,分析uc.40与PBX1的相互作用,论证uc.40通过调控PBX1致胚胎心脏发育异常的机制。阐明人uc.40这一未知功能lncRNA在胚胎心脏发育中的作用与机制,可能为先天性心脏病在妊娠期的早期防治提供新靶标。

项目摘要

Uc.40是我们采用芯片发现的、不同物种(人、大鼠、小鼠、斑马鱼)间高度保守、高表达于人发育异常胚胎心脏中、功能未知的一条lncRNA。研究拟分析uc.40在心脏发育中的时空表达规律;以基因过表达/沉默技术,在P19细胞、斑马鱼中探讨uc.40对心肌细胞功能和心脏发育的影响;以PBX1为线索,分析uc.40与PBX1的相互作用,论证uc.40通过调控PBX1致胚胎心脏发育异常的机制。研究结果显示:过表达uc.40显著抑制P19细胞向心肌细胞分化;过表达uc.40可致斑马鱼出现心脏畸形表型;进一步研究发现PBX1为uc.40的调控靶标;PBX1低表达于人发育异常胚胎心肌组织中,提示uc.40通过调节PBX1致胚胎心脏发育异常。该研究阐明人uc.40这一未知功能lncRNA在胚胎心脏发育中的作用与机制。该研究还探索了孕妇血浆中lncRNAs表达的改变在预测胎儿CHD中的价值。结果表明CHD胎儿孕妇血血浆中ENST00000436681、ENST00000422826、AA584040、AA709223及BX478947等5条lncRNAs可为作为一个种无创胎儿CHD产前诊断的新的生物标志物。该研究为先天性心脏病在妊娠期的早期防治提供新靶标。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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